Objectif
The genomes of pathogenic bacteria often contain multiple copies of genes with similar sequence. The encoded proteins are generally secreted or associated with the bacterial surface and are thus likely to be involved in the host-pathogen interaction. However, the functions of these multigene families in pathogenesis remain largely unknown. We will investigate the role of bacterial multigene family proteins in the host-pathogen interaction taking a Systems Biology-based approach. We will focus on two model pathogen-specific virulence-related proteins families: the Inl (internalin) proteins from the gram-positive genus Listeria, and the Vap (virulence-associated) proteins from Rhodococcus equi, a pathogenic actinomycete related to Mycobacterium tuberculosis (MTB). We will also investigate the Mce and PE/PPE proteins, which are distributed among several pathogenic actinobacteria including R. equi and MTB. Different members of these multigene families are found in genotypes or species differing in virulence and pathogenic tropism. Our hypothesis is that the specific multigene complements carried by the different “pathovars” contribute to their distinct pathogenic properties. We will address the research question by systematically identifying binding partners to the investigated proteins and relevant domains thereof by interaction proteomics using high-throughput yeast two-hybrid (Y2H) screens with large host (mammalian) cDNA prey libraries. We will then apply bioinformatics tools and network analysis to define the host subcellular compartments and functional networks and pathways targeted by the bacterial multigene family proteins, and the global contribution of the identified interactions to pathogenesis. Microbial surface-associated and excreted proteins are at the forefront of the host-pathogen interplay, mediating adherence/colonisation, subverting host pathways, or modulating innate or acquired immunity.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
EH8 9YL Edinburgh
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.