Ziel
The genomes of pathogenic bacteria often contain multiple copies of genes with similar sequence. The encoded proteins are generally secreted or associated with the bacterial surface and are thus likely to be involved in the host-pathogen interaction. However, the functions of these multigene families in pathogenesis remain largely unknown. We will investigate the role of bacterial multigene family proteins in the host-pathogen interaction taking a Systems Biology-based approach. We will focus on two model pathogen-specific virulence-related proteins families: the Inl (internalin) proteins from the gram-positive genus Listeria, and the Vap (virulence-associated) proteins from Rhodococcus equi, a pathogenic actinomycete related to Mycobacterium tuberculosis (MTB). We will also investigate the Mce and PE/PPE proteins, which are distributed among several pathogenic actinobacteria including R. equi and MTB. Different members of these multigene families are found in genotypes or species differing in virulence and pathogenic tropism. Our hypothesis is that the specific multigene complements carried by the different “pathovars” contribute to their distinct pathogenic properties. We will address the research question by systematically identifying binding partners to the investigated proteins and relevant domains thereof by interaction proteomics using high-throughput yeast two-hybrid (Y2H) screens with large host (mammalian) cDNA prey libraries. We will then apply bioinformatics tools and network analysis to define the host subcellular compartments and functional networks and pathways targeted by the bacterial multigene family proteins, and the global contribution of the identified interactions to pathogenesis. Microbial surface-associated and excreted proteins are at the forefront of the host-pathogen interplay, mediating adherence/colonisation, subverting host pathways, or modulating innate or acquired immunity.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Bakteriologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2009-IEF
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
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Koordinator
EH8 9YL Edinburgh
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.