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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

A phylogenetic and experimental approach to understand the evolution of microbiota

Objectif

Microbial communities (=microbiota) associated with multicellular organisms play an important role in host nutrition and development. Advances in sequencing technology have revealed an unexpectedly high diversity of microbiota; these advances are not, however, matched by advances in our understanding of the evolutionary factors that structure microbiota. The goal of this proposal is to fill this knowledge gap. Evolutionary models developed for simple host-symbiont relationships have identified a number of factors that shape these relationships: mode of transmission (horizontal versus maternal transmission), host ranges and fitness effects for the host. Together these factors influence the role of selection among hosts and the role of selection within hosts (among microbes), the two levels of selection that are believed to shape host-symbiont coevolution. Here I intend to expand these models to host - microbiota interactions.
My objectives are to use next-generation sequencing to conduct a comparative study of bacterial microbiota structure and to combine this work with experiments that explore the underlying evolutionary processes. I will focus on the crustacean family Daphniidae (mainly the genus Daphnia)¿a system ideally suited for studies in the field and laboratory. I will test hypotheses about the evolution of mutualism, virulence, cheating and coevolution, as well as test for the role of mode of transmission and host specificity. The analysis of host-microbiota associations will be conducted for entire microbiota and for stepwise simplified, but biologically meaningful subsets.
Testing general models for the evolution of microbiota will have implications far beyond the chosen model system, ranging from ecology and evolution to agricultural sciences and medicine. The proposed study is innovative, significant and risk-taking and will combine skills in evolutionary biology, experimental design, bioinformatics and molecular biology.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

ERC-2010-AdG_20100317
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-AG - ERC Advanced Grant

Institution d’accueil

UNIVERSITAT BASEL
Contribution de l’UE
€ 2 446 004,00
Adresse
PETERSPLATZ 1
4051 Basel
Suisse

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Région
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Bénéficiaires (1)

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