Ziel
"Protein-protein interactions play critical roles in normal human physiology, as well as in numerous diseases such as cancers and neurodegenerative disorders. However, identifying small molecule drugs to block protein interactions is a very difficult task. One of the major difficulties is that often the proteins involved are extremely flexible and readily change shape, which greatly complicates efforts to find small molecule ligands of matching shape. In this project, we aim to exploit protein flexibility to create new opportunities for drug discovery.
Interactions between a given pair of proteins commonly requires one or both partners to transiently form pockets that allow selective binding. Therefore, most protein interfaces likely possess many more binding pockets than those apparent in the static picture of a protein structure revealed by crystallographic experiments. We propose to identify these ""hidden"" pockets using computational methods. Thus, we will develop and validate molecular simulation methodologies to detect hidden pockets at protein interfaces and assess their small molecule ""druggability"" using docking calculations and binding site scoring functions. Such capacity would greatly strengthen the reliability of in silico drug design. We will perform virtual screens to find small molecule ligands binding to hidden pockets in medicinally important proteins such as FcgammaRIIA or PCNA. Finally, we will purchase or synthesize promising ligands and assay their activity against protein targets. These studies will allow us to test the utility of our computational approach in rational drug design.
The objectives of this research are part of a broader program we are currently developing and whose purpose is to provide a comprehensive set of computational/biophysical methods to allow the widespread targeting of seemingly ""undruggable"" protein families with small molecules, thereby expanding the scope of modern molecular medicine."
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2010-RG
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
EH8 9YL Edinburgh
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.