Ziel
Genetic sequences have had an enormous impact on our understanding of biology. The expectation is that biological network data will have a similar impact. However, progress is hindered by a lack of sophisticated graph theoretic tools that will mine these large networked datasets.
In recent breakthrough work at the boundary of computer science and biology supported by my USA NSF CAREER award, I developed sensitive network analysis, comparison and embedding tools which demonstrated that protein-protein interaction networks of eukaryotes are best modeled by geometric graphs. Also, they established phenotypically validated, unprecedented link between network topology and biological function and disease. Now I propose to substantially extend these preliminary results and design sensitive and robust network alignment methods that will lead to uncovering unknown biology and evolutionary relationships. The potential ground-breaking impact of such network alignment tools could be parallel to the impact the BLAST family of sequence alignment tools that have revolutionized our understanding of biological systems and therapeutics. Furthermore, I propose to develop additional sophisticated graph theoretic techniques to mine network data and hence complement biological information that can be extracted from sequence. I propose to exploit these new techniques for biological applications in collaboration with experimentalists at Imperial College London: 1. aligning biological networks of species whose genomes are closely related, but that have very different phenotypes, in order to uncover systems-level factors that contribute to pronounced differences; 2. compare and contrast stress response pathways and metabolic pathways in bacteria in a unified systems-level framework and exploit the findings for: (a) bioengineering of micro-organisms for industrial applications (production of bio-fuels, bioremediation, production of biopolymers); (b) biomedical applications.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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ERC-2011-StG_20101014
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Gastgebende Einrichtung
WC1E 6BT LONDON
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.