Ziel
The overall aim of this proposal is to understand how individual genetic and epigenetic variation in the Major Histocompatibility Complex (MHC) on chromosome 6p21 may determine susceptibility to autoimmune, infectious and inflammatory disease. The human MHC is a paradigm for genomics, showing remarkable polymorphism and striking association with disease, but causal genetic variants remain largely unresolved. The identification of specific disease risk variants is particularly challenging in the MHC due to the extent of genetic diversity now recognised, the complexity of coinheritance between genetic markers and the difficulty of resolving specific regulatory variants modulating gene expression. We have previously established the importance of allele-specific gene expression in the MHC at specific loci including the TNF, HSP70 and HLA-DRB1 genes. We now propose a comprehensive global analysis for the MHC addressing the following specific objectives: (1) to define allele-specific transcription across the classical MHC for disease associated haplotypes in specific peripheral blood cells using RNA sequencing; (2) to compliment this by identifying allelic differences in gene regulation at the level of chromatin structure and histone modifications; (3) to resolve DNA sequence variants associated with differences in MHC gene expression by quantitative trait mapping in healthy volunteers; (4) to investigate the extent and consequences of allele-specific DNA methylation in the MHC; (5) to functionally characterise specific gene loci showing evidence of allele-specific gene expression in the context of reported disease associations. The proposal is scientifically ambitious, using cutting edge genomic technologies to address in innovative ways a major roadblock in this field of scientific research. The work is of significant translational importance as we apply genomic medicine to improve care for the individual patient and advance our understanding of disease pathogenesis.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Gesundheitswissenschaften entzündliche Krankheiten
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS Transkriptome
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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ERC-2011-StG_20101109
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Gastgebende Einrichtung
OX1 2JD Oxford
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.