Objectif
Polycomb group (PcG) and Trithorax group (TrxG) proteins are essential for maintaining different cell identities through chromatin-based regulation of gene expression during development. A crucial aspect of this system is the competition of PcG and TrxG proteins for cis-regulatory DNA elements called Polycomb Response Elements (PREs). However, the mechanisms underlying this competition remain largely unknown. Recent studies have shown that PREs are nucleosome-depleted sites, as a result of high nucleosome turnover in Drosophila. In addition, our preliminary results suggest that these transient nucleosomes at PREs are required for Polycomb-mediated repression. Here, we propose to test the idea that PRE chromatin structure dynamically alternates between two states, where PcG proteins initially bind to transient PRE nucleosomes, and TrxG proteins displace these nucleosomes allowing access to underlying binding sites in the DNA. First, we will evaluate the relevance of transient PRE nucleosomes for establishment and maintenance of target gene expression patterning in vivo. Second, we will implement an innovative technique for genome-scale epigenomic profiling, based on Micrococcal nuclease digestion and high-throughput DNA sequencing. Our recent work shows that this method reveals every site that is occupied by DNA-binding proteins and nucleosomes. We will use this technique in wild-type and nucleosome-depleted cells to assess the roles of transient nucleosomes for chromatin organization at PREs. Finally, we will directly test the role for transient nucleosomes in the recruitment of PcG/TrxG complexes at PREs by chromatin immunoprecipitation analysis. This project will explore links between nucleosome turnover and PRE function, while achieving significant technological innovation. The outgoing phase will be hosted by Dr. Kami Ahmad at Harvard Medical School, in Boston, while Dr. Geneviève Almouzni at the Curie Institute, in Paris will be the return host.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IOF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
75231 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.