Obiettivo
Polycomb group (PcG) and Trithorax group (TrxG) proteins are essential for maintaining different cell identities through chromatin-based regulation of gene expression during development. A crucial aspect of this system is the competition of PcG and TrxG proteins for cis-regulatory DNA elements called Polycomb Response Elements (PREs). However, the mechanisms underlying this competition remain largely unknown. Recent studies have shown that PREs are nucleosome-depleted sites, as a result of high nucleosome turnover in Drosophila. In addition, our preliminary results suggest that these transient nucleosomes at PREs are required for Polycomb-mediated repression. Here, we propose to test the idea that PRE chromatin structure dynamically alternates between two states, where PcG proteins initially bind to transient PRE nucleosomes, and TrxG proteins displace these nucleosomes allowing access to underlying binding sites in the DNA. First, we will evaluate the relevance of transient PRE nucleosomes for establishment and maintenance of target gene expression patterning in vivo. Second, we will implement an innovative technique for genome-scale epigenomic profiling, based on Micrococcal nuclease digestion and high-throughput DNA sequencing. Our recent work shows that this method reveals every site that is occupied by DNA-binding proteins and nucleosomes. We will use this technique in wild-type and nucleosome-depleted cells to assess the roles of transient nucleosomes for chromatin organization at PREs. Finally, we will directly test the role for transient nucleosomes in the recruitment of PcG/TrxG complexes at PREs by chromatin immunoprecipitation analysis. This project will explore links between nucleosome turnover and PRE function, while achieving significant technological innovation. The outgoing phase will be hosted by Dr. Kami Ahmad at Harvard Medical School, in Boston, while Dr. Geneviève Almouzni at the Curie Institute, in Paris will be the return host.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IOF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
75231 Paris
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.