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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

A Direct Role for Nucleosome Turnover in Polycomb Response Element Function

Ziel

Polycomb group (PcG) and Trithorax group (TrxG) proteins are essential for maintaining different cell identities through chromatin-based regulation of gene expression during development. A crucial aspect of this system is the competition of PcG and TrxG proteins for cis-regulatory DNA elements called Polycomb Response Elements (PREs). However, the mechanisms underlying this competition remain largely unknown. Recent studies have shown that PREs are nucleosome-depleted sites, as a result of high nucleosome turnover in Drosophila. In addition, our preliminary results suggest that these transient nucleosomes at PREs are required for Polycomb-mediated repression. Here, we propose to test the idea that PRE chromatin structure dynamically alternates between two states, where PcG proteins initially bind to transient PRE nucleosomes, and TrxG proteins displace these nucleosomes allowing access to underlying binding sites in the DNA. First, we will evaluate the relevance of transient PRE nucleosomes for establishment and maintenance of target gene expression patterning in vivo. Second, we will implement an innovative technique for genome-scale epigenomic profiling, based on Micrococcal nuclease digestion and high-throughput DNA sequencing. Our recent work shows that this method reveals every site that is occupied by DNA-binding proteins and nucleosomes. We will use this technique in wild-type and nucleosome-depleted cells to assess the roles of transient nucleosomes for chromatin organization at PREs. Finally, we will directly test the role for transient nucleosomes in the recruitment of PcG/TrxG complexes at PREs by chromatin immunoprecipitation analysis. This project will explore links between nucleosome turnover and PRE function, while achieving significant technological innovation. The outgoing phase will be hosted by Dr. Kami Ahmad at Harvard Medical School, in Boston, while Dr. Geneviève Almouzni at the Curie Institute, in Paris will be the return host.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP7-PEOPLE-2011-IOF
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Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MC-IOF - International Outgoing Fellowships (IOF)

Koordinator

INSTITUT CURIE
EU-Beitrag
€ 280 017,60
Adresse
RUE D ULM 26
75231 Paris
Frankreich

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Region
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

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