Objectif
"In bacteria, DNA transposons play a key role in transferring antibiotic resistance, which poses a major threat to human health. I want to understand how this transfer can be controlled. One of the regulatory pathways applied in vivo uses specific small RNAs (sRNAs) controlling translation of the transposase mRNA. This is achieved using the general bacterial RNA regulatory machinery, and is mediated by the small RNA chaperone, HFQ. HFQ is a highly conserved, SM-like protein that modifies the secondary and tertiary structure of sRNAs and mRNAs, supports RNA unfolding and annealing and thereby regulates mRNA translation. In addition, HFQ also recruits the RNA degradation machinery through interaction with the endonuclease RNaseE and the poly(A)-polymerase PAP-I. Now I aim to understand the mechanism of sRNA-mediated regulation of transposition and the general gene silencing process in bacteria, applying an integrated structural biology approach. Using fluorescence anisotropy, SPR, FRET, NMR spectroscopy and X-ray crystallography, I will study the structural changes of Tn10 derived RNAs upon binding to HFQ, the structure of the ribonucleoprotein complexes involved and the dynamics of RNA-folding and annealing. Furthermore, to investigate the intimate link between sRNA based translation regulation and RNA degradation, I will also analyze how HFQ interacts with RNaseE and PAP-I, and how these interactions affect the function of these RNA processing factors.
My study will not only reveal the mechanism of sRNA based regulation of transposition, but also provide insights into the general RNA chaperoning functions of HFQ and a comprehensive picture about the macromolecular complexes and dynamic events involved in sRNA mediated gene regulation. On the long term, I envision that down regulation of transposition may offer a way to inhibit the transmission of antibiotic resistances, which would be of greatest medical interest."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie spectrométrie d’absorption
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments résistance aux antibiotiques
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
69117 Heidelberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.