Obiettivo
The aim of this project is to uncover a novel regulatory mechanism that explains how cells change their membrane lipid composition and trafficking as a function of population context, and how that is used to adapt the cell’s physiology to its microenvironment. To do so, I will use single cell microscopy over large populations, lipidomic, phosphoproteomic and microarray analysis of mice cells deleted from Focal Adhesion Kinase (FAK).
When cells grow at low local cell density or at the edges of cell islets, FAK becomes activated. This event activates signalling and gene regulation. Interestingly, silencing of FAK strongly impairs sphingolipid GM1 amount at the plasma membrane and fate through clathrin-independent endocytosis, leading to drastic diminution of Simian Virus 40 (SV40) infection. Microarray analysis of FAK-KO cells and Wild Type, in dense and sparse contexts, shows that lysosomal, Golgi apparatus and trafficking genes are controlled by activated Focal Adhesion Kinase. ABCA1, a membrane scrambler and cholesterol efflux mediator, is the second overall strongest hit and the only membrane protein amongst the top hits. Strikingly the loss-of-FAK phenotype in cell spreading and growth can be reversed by inhibiting ABCA1, suggesting that FAK act on membranes by controlling ABCA1 production.
I would like to characterise the actors and dynamics of the FAK-ABCA1 system to understand how it couples membrane composition and clathrin-independent trafficking to local environments. I will apply i)phosphoproteomic approach and chromatin Immunoprecipitation for finding key signalling axis from FAK activation to gene regulation, ii)lipidomic for characterizing FAK effect on membrane composition, and iii)leading edge single cell microscopy over large populations both in live or fixed conditions in order to characterise the FAK-ABCA1 system effect on membrane ordering and sphingolipid endocytosis to the Golgi apparatus or lysosome, as a function of cell density
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche microbiologia virologia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze fisiche ottica microscopia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole lipidi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
8006 ZURICH
Svizzera
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.