Objectif
Voltage sensing is a crucial property for a variety of proteins involved in many physiological functions (selective ion transport through membranes, enzymatic catalysis…). All these proteins achieve voltage sensing through the action of a 4 alpha-helix bundle module called the voltage-sensor domain (VSD). This transmembrane module achieves its function thanks to specific features, such as the presence of a large number of conserved charged or hydrophobic residues isolating the intracellular domain from the extracellular one. Despite these common features, nature achieves a surprising variability in terms of voltage-sensing properties, i.e. the thermodynamic and kinetic properties characterizing VSD activation span a wide range of values among the VSD superfamily. What are the residues responsible for such modulation and how this variability is achieved is not yet understood and is of great interest from a medical perspective, as it would shed light onto the effect of
disease-involved mutation of crucial residues (channelopathies).
This proposal offers to use the arsenal of computational methods derived from theoretical chemistry (molecular dynamics simulations using atomistic and polarizable force fields, free energy calculations, QM/MM calculations, force matching algorithms…) and bioinformatics (homology modeling, evolutionary modeling…) to unravel this question. The proposal unfolds in three steps: the first involves developing a robust framework to evaluate the thermodynamic and kinetic properties of activation of a specific VSD. The second consists in evaluating the impact of the mutation of specific residues on the parameters determined in step 1, while validating and refining the theoretical framework through comparison of these results to experimental ones from our collaborators. The final step consists in integrating this data in an evolutionary model including a variety of VSDs.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles informatique et science de l'information science informatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2012-IOF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1015 LAUSANNE
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.