Objectif
Protection of genome integrity is crucial for maintaining cell identity and viability. However, the organisation of DNA with histone proteins into chromatin in eukaryotic cell nuclei poses structural constraints to the detection and repair of DNA lesions. Dynamic and tightly controlled changes in chromatin organisation are thus critical for an efficient response to DNA damage, while at the same time preserving chromatin integrity. Yet, the underlying regulatory mechanisms are still poorly characterised, particularly in higher eukaryotes.
Here, we describe a range of complementary approaches using cutting-edge imaging to address this issue in mammalian cells. Our aim is to investigate DNA damage-induced alterations at distinct levels of chromatin organisation, from histone proteins up to higher-order chromatin structure, and to explore the underlying mechanisms.
(1) We first intend to provide a detailed analysis of histone variant dynamics at DNA damage sites by combining local induction of DNA lesions with pulse-chase imaging of histone proteins. (2) To examine how these dynamics are reflected at the level of higher-order chromatin folding, we will quantitatively visualise changes in chromatin compaction in cells exposed to genotoxic stress. For this, we will implement a recent FLIM-FRET-based approach and also exploit super-resolution fluorescence microscopy. (3) We will examine the spatio-temporal regulation of damaged chromatin reorganisation, analyse how it connects with DNA damage signalling and repair pathways, and characterise the histone chaperones and chromatin remodelling factors involved. (4) To broaden the range of candidate regulatory factors, we will screen for novel players in the DNA damage response among chromatin-associated proteins using laser micro-irradiation induced damage.
Altogether, these integrated approaches should provide new insights into the molecular mechanisms that coordinate the maintenance of genome and epigenome integrity.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie microscopie à super-résolution
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences physiques optique physique des lasers
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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ERC-2013-StG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
75794 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.