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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Policing mammalian transcriptomes: regulation of long ncRNA synthesis by transcriptional termination, gene loops and R-loops

Objectif

.Mammalian transcriptome analysis reveals that while most of the genome is transcribed, only a minority fraction produces protein coding, messenger RNA or functional, structural RNA. Instead a substantial fraction is transcribed, often tissue specifically, into long non coding (lnc)RNA of mostly unknown function. Many lncRNA are rapidly degraded and may reflect promiscuous, non-functional transcription. However some lncRNA have important cellular functions. I reason that defining promoters and terminators of lncRNA genes will provide valuable information on which lncRNA are likely to be functional. LncRNA gene promoters often correspond to nucleosome depleted regions of protein coding gene promoters and enhancers, which generate bidirectional transcription. Regions of single-strand DNA, exposed by R-loop formation can also initiate transcription and so act as a potential source of lncRNA, as will be investigated here. Since transcription initiation of lncRNA genes appears relatively promiscuous, terminating lncRNA transcription may be of critical importance. This will prevent read-through transcription with consequent negative affects on downstream genes by transcriptional interference or the formation of overlapping transcripts leading to RNA interference effects. Consequently I will focus on transcription termination mechanisms of lncRNA genes. I will determine if known protein coding gene terminators also operate for lncRNA genes or whether many lncRNA use alternative termination mechanisms. In particular I will investigate the role of G-rich pausing elements that promote Pol II termination by forming R-loop structures on lncRNA genes. I will also investigate which classes of lncRNA genes form gene loop conformations when transcribed, as a likely identifier of more highly expressed, functional lncRNA. Overall I predict that understanding how lncRNA are synthesised will provide critical information on which lncRNA warrant scrutiny as likely functional transcripts

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

ERC-2013-ADG
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-AG - ERC Advanced Grant

Institution d’accueil

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Contribution de l’UE
€ 2 499 464,00
Adresse
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Royaume-Uni

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Région
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Bénéficiaires (1)

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