Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-06-18

Policing mammalian transcriptomes: regulation of long ncRNA synthesis by transcriptional termination, gene loops and R-loops

Cel

.Mammalian transcriptome analysis reveals that while most of the genome is transcribed, only a minority fraction produces protein coding, messenger RNA or functional, structural RNA. Instead a substantial fraction is transcribed, often tissue specifically, into long non coding (lnc)RNA of mostly unknown function. Many lncRNA are rapidly degraded and may reflect promiscuous, non-functional transcription. However some lncRNA have important cellular functions. I reason that defining promoters and terminators of lncRNA genes will provide valuable information on which lncRNA are likely to be functional. LncRNA gene promoters often correspond to nucleosome depleted regions of protein coding gene promoters and enhancers, which generate bidirectional transcription. Regions of single-strand DNA, exposed by R-loop formation can also initiate transcription and so act as a potential source of lncRNA, as will be investigated here. Since transcription initiation of lncRNA genes appears relatively promiscuous, terminating lncRNA transcription may be of critical importance. This will prevent read-through transcription with consequent negative affects on downstream genes by transcriptional interference or the formation of overlapping transcripts leading to RNA interference effects. Consequently I will focus on transcription termination mechanisms of lncRNA genes. I will determine if known protein coding gene terminators also operate for lncRNA genes or whether many lncRNA use alternative termination mechanisms. In particular I will investigate the role of G-rich pausing elements that promote Pol II termination by forming R-loop structures on lncRNA genes. I will also investigate which classes of lncRNA genes form gene loop conformations when transcribed, as a likely identifier of more highly expressed, functional lncRNA. Overall I predict that understanding how lncRNA are synthesised will provide critical information on which lncRNA warrant scrutiny as likely functional transcripts

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

ERC-2013-ADG
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

ERC-AG - ERC Advanced Grant

Instytucja przyjmująca

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Wkład UE
€ 2 499 464,00
Adres
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Zjednoczone Królestwo

Zobacz na mapie

Region
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Rodzaj działalności
Higher or Secondary Education Establishments
Linki
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych

Beneficjenci (1)

Moja broszura 0 0