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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-29

The ecological roles of planktonic archaeal and bacterial ammonia oxidizers in the oceanic nitrogen cycle

Objetivo

This proposal aims at determining the role of planktonic ammonia-oxidizing archaea (AOA) versus ammonia-oxidizing bacteria (AOB) in the marine pelagic environments that are critical for global nitrogen cycle. This will be accomplished by using a combination of conventional enrichment techniques with recently developed molecular methods.

By means of a modified catalyzed reporter deposition fluorescence in situ hybridization (CARD-FISH) method and quantitative PCR technology, the abundance of the major prokaryotic groups of ammonia-oxidizers (AOB and AOA) will be determined in two coastal ecosystems (Irish and Black Sea) as compared to meso- and bathypelagic deep water of the Atlantic ocean.

Combining this method with micro-autoradiography we will be able to determine inorganic N uptake of individual cells and relate this to the measurements on bulk archaeal and prokaryotic community.

AOB and AOA distribution and diversity will be determined via terminal-restriction fragment polymorphism analysis of ammonia monooxygenase (amoA) genes combined with construction of environmental DNA bank for each sampling site.

Specific new oligonucleotide probes for dominant ammonia-species will be designed and applied in the MICRO-FISH assay to determine interspecific differences in the utilization and activity of coastal and deep water ammonia-oxidizers.

Seawater batch cultures with coastal and deep ocean water will be used to isolate new AOA and AOB species using a laboratory enrichment and cultivation approach. The obtained pure culture and environmental samples will be used for quantitative analysis of archaeal and bacterial nitrification amoA and denitrification nirK and norB gene expression in microcosms experiments.

While the AOB and AOA genes and enzymes involved in ammonia oxidation and N2O production have been recently isolated, the extent to which AOA and AOB are actively oxidizing ammonia and/or producing N2O under varying environmental conditions has never been studied before.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2005-MOBILITY-5
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Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinador

UNIVERSITY OF LIVERPOOL
Aportación de la UE
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Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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