Ziel
This proposal aims at determining the role of planktonic ammonia-oxidizing archaea (AOA) versus ammonia-oxidizing bacteria (AOB) in the marine pelagic environments that are critical for global nitrogen cycle. This will be accomplished by using a combination of conventional enrichment techniques with recently developed molecular methods.
By means of a modified catalyzed reporter deposition fluorescence in situ hybridization (CARD-FISH) method and quantitative PCR technology, the abundance of the major prokaryotic groups of ammonia-oxidizers (AOB and AOA) will be determined in two coastal ecosystems (Irish and Black Sea) as compared to meso- and bathypelagic deep water of the Atlantic ocean.
Combining this method with micro-autoradiography we will be able to determine inorganic N uptake of individual cells and relate this to the measurements on bulk archaeal and prokaryotic community.
AOB and AOA distribution and diversity will be determined via terminal-restriction fragment polymorphism analysis of ammonia monooxygenase (amoA) genes combined with construction of environmental DNA bank for each sampling site.
Specific new oligonucleotide probes for dominant ammonia-species will be designed and applied in the MICRO-FISH assay to determine interspecific differences in the utilization and activity of coastal and deep water ammonia-oxidizers.
Seawater batch cultures with coastal and deep ocean water will be used to isolate new AOA and AOB species using a laboratory enrichment and cultivation approach. The obtained pure culture and environmental samples will be used for quantitative analysis of archaeal and bacterial nitrification amoA and denitrification nirK and norB gene expression in microcosms experiments.
While the AOB and AOA genes and enzymes involved in ammonia oxidation and N2O production have been recently isolated, the extent to which AOA and AOB are actively oxidizing ammonia and/or producing N2O under varying environmental conditions has never been studied before.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP6-2005-MOBILITY-5
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
7ZX LIVERPOOL
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.