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Contenuto archiviato il 2024-05-29

The ecological roles of planktonic archaeal and bacterial ammonia oxidizers in the oceanic nitrogen cycle

Obiettivo

This proposal aims at determining the role of planktonic ammonia-oxidizing archaea (AOA) versus ammonia-oxidizing bacteria (AOB) in the marine pelagic environments that are critical for global nitrogen cycle. This will be accomplished by using a combination of conventional enrichment techniques with recently developed molecular methods.

By means of a modified catalyzed reporter deposition fluorescence in situ hybridization (CARD-FISH) method and quantitative PCR technology, the abundance of the major prokaryotic groups of ammonia-oxidizers (AOB and AOA) will be determined in two coastal ecosystems (Irish and Black Sea) as compared to meso- and bathypelagic deep water of the Atlantic ocean.

Combining this method with micro-autoradiography we will be able to determine inorganic N uptake of individual cells and relate this to the measurements on bulk archaeal and prokaryotic community.

AOB and AOA distribution and diversity will be determined via terminal-restriction fragment polymorphism analysis of ammonia monooxygenase (amoA) genes combined with construction of environmental DNA bank for each sampling site.

Specific new oligonucleotide probes for dominant ammonia-species will be designed and applied in the MICRO-FISH assay to determine interspecific differences in the utilization and activity of coastal and deep water ammonia-oxidizers.

Seawater batch cultures with coastal and deep ocean water will be used to isolate new AOA and AOB species using a laboratory enrichment and cultivation approach. The obtained pure culture and environmental samples will be used for quantitative analysis of archaeal and bacterial nitrification amoA and denitrification nirK and norB gene expression in microcosms experiments.

While the AOB and AOA genes and enzymes involved in ammonia oxidation and N2O production have been recently isolated, the extent to which AOA and AOB are actively oxidizing ammonia and/or producing N2O under varying environmental conditions has never been studied before.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2005-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinatore

UNIVERSITY OF LIVERPOOL
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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