Objectif
This proposal aims at determining the role of planktonic ammonia-oxidizing archaea (AOA) versus ammonia-oxidizing bacteria (AOB) in the marine pelagic environments that are critical for global nitrogen cycle. This will be accomplished by using a combination of conventional enrichment techniques with recently developed molecular methods.
By means of a modified catalyzed reporter deposition fluorescence in situ hybridization (CARD-FISH) method and quantitative PCR technology, the abundance of the major prokaryotic groups of ammonia-oxidizers (AOB and AOA) will be determined in two coastal ecosystems (Irish and Black Sea) as compared to meso- and bathypelagic deep water of the Atlantic ocean.
Combining this method with micro-autoradiography we will be able to determine inorganic N uptake of individual cells and relate this to the measurements on bulk archaeal and prokaryotic community.
AOB and AOA distribution and diversity will be determined via terminal-restriction fragment polymorphism analysis of ammonia monooxygenase (amoA) genes combined with construction of environmental DNA bank for each sampling site.
Specific new oligonucleotide probes for dominant ammonia-species will be designed and applied in the MICRO-FISH assay to determine interspecific differences in the utilization and activity of coastal and deep water ammonia-oxidizers.
Seawater batch cultures with coastal and deep ocean water will be used to isolate new AOA and AOB species using a laboratory enrichment and cultivation approach. The obtained pure culture and environmental samples will be used for quantitative analysis of archaeal and bacterial nitrification amoA and denitrification nirK and norB gene expression in microcosms experiments.
While the AOB and AOA genes and enzymes involved in ammonia oxidation and N2O production have been recently isolated, the extent to which AOA and AOB are actively oxidizing ammonia and/or producing N2O under varying environmental conditions has never been studied before.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences chimiques électrochimie électrolyse
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
- sciences naturelles sciences biologiques écologie écosystème écosystème côtier
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2005-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
7ZX LIVERPOOL
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.