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Inhalt archiviert am 2024-05-29

A bioinformatics and systems biology approach for the functional analysis of a growth-regulating MAP kinase pathway in Arabidopsis

Ziel

This proposal contains fundamental science, but within one of the central aspects that make plants of vital importance for humanity: their growth and development. It is increasingly clear that biomass is one of the few sustainable energy alternatives. The mitogen-activated protein kinase (MAPK) phosphorylation cascades are conserved signalling modules in all eukaryotes and have pivotal roles to regulate cell division and cell growth in animals but such roles in plants are just emerging. Specifically, in my work I recently discovered that group D MAPK kinases potentially regulate plant growth and development. Within this project I propose to focus on MKK9, because it is also stress induced, and bioinformatics analysis shows co-regulation with genes important in growth and environmental adaptation. A close collaboration between the School of Biological Sciences, and the Computer Sciences at Royal Holloway, University of London, will enable me to build a novel system's biology approach to reach my goals.

My work program is designed around six modules;
1. molecular genetics studies of MKK9 by analysing insertional mutants, RNAi and over-expression lines,
2. detailed phenotypic analysis of these lines
3. genome-wide transcriptomics with inducible gain of function mutant forms to find downstream targets,
4. bioinformatics analysis of the transcriptome data that we obtain, and the public databases to find candidate target genes, and coregulated genes,
5. high-throughput functional analysis of the MKK9 signalling pathway by a cell transfection system and promoter reporter gene readout and finally
6. model building that utilise gene antology (GO) terms and computer language, which will allow to make predictions and plan further experiments on the whole plant level towards the goal of attaining plants with better yield and stress tolerance.

This multidisciplinary program should enable me to reach professional maturity and to establish a research career upon return to Hungary.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP6-2005-MOBILITY-5
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Koordinator

ROYAL HOLLOWAY AND BEDFORD NEW COLLEGE
EU-Beitrag
Keine Daten
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0