Ziel
Translation maps the transcriptome onto the proteome. It is regulated at the initiation levels and also by mRNA secondary structure, and – our current focus – by the interplay between the mRNA and tRNA pools. Although a lot is known about the mechanics of translation, its effects on physiology, particularly on proliferation and differentiation in mammals presents major open questions.
tRNAProlif offers an approach that consists of genome-wide measurements and analyses of the tRNA and mRNAs pools, and the interplay between them, in proliferative and differentiated cells. The project will explain how changes in translation affect, and are affected by, these two states.
We rely on our preliminary results that show a striking dichotomy in codon usage: genes involved in cellular proliferation have distinct codon usage compared to genes involved in differentiation and other multi-cellular process. Further, the tRNA pool consists of two distinct sub-populations: tRNAs whose codons are enriched among the proliferation genes are induced in proliferation and cancer, and tRNAs whose codons are enriched in differentiation genes are repressed in proliferation and are induced in differentiation. Towards understanding this “tRNA Switch” we aim at:
Causality: We will determine whether the tRNA pool affects the proliferation/differentiation status of cell. Conversely, we will determine the effects of the proliferation/differentiation status on the tRNA pool.
Regulation: We will establish the regulatory scheme that governs the “tRNA Switch”: we will determine the effects of transcriptional and post-transcriptional regulation on the tRNAs, depending on cell state. We will determine how the balance between the two tRNA sub-populations affects the proteome.
Evolution: We will conduct comparative genomics of regulation of tRNA availability and codon usage and its effect on physiology in multiple species.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Onkologie
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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ERC-2013-CoG
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Gastgebende Einrichtung
7610001 Rehovot
Israel
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.