Objectif
Membrane protein transporters catalyze fundamental physiological processes in all kingdoms of life. A schematic view of membrane transport is emerging from a growing number of crystal structures. However, several fundamental features of membrane protein transport are still evasive, such as how the protein transition between states, what triggers these structural rearrangements, and how the release of energy is coupled to the transport event. The proposed research will build an interdisciplinary platform, which uses molecular biology, biophysical and computational techniques, to characterize membrane protein transport over the full spatio-temporal scale. Molecular dynamics (MD) simulations will capture high-resolution dynamics on the nano-to-microsecond timescale, which will identify communicative salt-bridge/H-bond networks, putative transport pathways, and the energetics involved in substrate transport. Predictions from the simulations will be verified by in vitro characterization of mutagenic phenotypes. Time-resolved wide-angle X-ray scattering (TR-WAXS) will monitor the micro-to-millisecond, large-scale structural rearrangements, which are out of reach for the MD simulations. The proposed platform for characterization of membrane protein transporters will be developed using a copper-transporting P-type ATPase (CopA) as the initial model system. The P-type ATPase family is divided into types I-V, depending on the transported substrate. CopA is the first crystal structure from the type-I ATPases, making it a particularly exciting model system. The applicants’ preliminary molecular dynamics (MD) simulations and the CopA transmembrane architecture strongly indicate a unique mode of transport in type-I ATPases. Hence, by means of visualization of copper transport, this proposal enables the development of an interdisciplinary European platform for multifaceted characterization of membrane transport that will be extendable to a range of membrane protein targets.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux cristaux
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
100 44 Stockholm
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.