Objectif
The crucial biological functions of the human microbiome in health are currently being investigated with metagenomic approaches that sequence whole microbial communities from in vivo samples. The involvement of the microbiome in autoimmune diseases has been proven, and the technological transition to the second generation community-wide full-genome shotgun sequencing is potentially enabling deeper, mechanistic, and functional microbiome profiles. However, the full potential of shotgun sequencing is currently unexpressed because effective methods to analyse the produced data are missing and only few partial hypothesis-driven datasets are available. The goal of CoMeMIMP is to make a multidisciplinary breakthrough in both the analysis of shotgun metagenomic data and in the understanding of (i) the role of the human microbiome during infection and (ii) the vertical sources of the microbial and probiotic diversity in the colonizing infant gut microbiome. On the methodological aspect, I already developed the fastest and most accurate taxonomic profiling methods available, and we will fully express here the potential of metagenomic data with unprecedented strain-level resolution for all domains of life, phylogenetic/phylogenomic structure mining, and statistical predictive tools. This will have a major research impact and will provide us with invaluable additional power to address the specific hypothesis that the microbiome dictates the acquisition and severity of infections from opportunistic pathogens, and to accurately track the mother-to-infant vertical transmission of transient and resilient commensal microbiomes. We will produce and analyse metagenomic longitudinal datasets including both the microbiome and pathogen isolates in patients with cystic fibrosis, and a comprehensive map of microbial transmission from the human milk microbiome and skin to the developing infant gut microbiome paving the way to new therapeutic and probiotic intervention strategies.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie maladies auto-immunes
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
38122 Trento
Italie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.