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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Computational shotgun metagenomics to detail mother-to-infant vertical microbiome transmission and microbiome-pathogen interaction in Cystic Fibrosis

Obiettivo

The crucial biological functions of the human microbiome in health are currently being investigated with metagenomic approaches that sequence whole microbial communities from in vivo samples. The involvement of the microbiome in autoimmune diseases has been proven, and the technological transition to the second generation community-wide full-genome shotgun sequencing is potentially enabling deeper, mechanistic, and functional microbiome profiles. However, the full potential of shotgun sequencing is currently unexpressed because effective methods to analyse the produced data are missing and only few partial hypothesis-driven datasets are available. The goal of CoMeMIMP is to make a multidisciplinary breakthrough in both the analysis of shotgun metagenomic data and in the understanding of (i) the role of the human microbiome during infection and (ii) the vertical sources of the microbial and probiotic diversity in the colonizing infant gut microbiome. On the methodological aspect, I already developed the fastest and most accurate taxonomic profiling methods available, and we will fully express here the potential of metagenomic data with unprecedented strain-level resolution for all domains of life, phylogenetic/phylogenomic structure mining, and statistical predictive tools. This will have a major research impact and will provide us with invaluable additional power to address the specific hypothesis that the microbiome dictates the acquisition and severity of infections from opportunistic pathogens, and to accurately track the mother-to-infant vertical transmission of transient and resilient commensal microbiomes. We will produce and analyse metagenomic longitudinal datasets including both the microbiome and pathogen isolates in patients with cystic fibrosis, and a comprehensive map of microbial transmission from the human milk microbiome and skin to the developing infant gut microbiome paving the way to new therapeutic and probiotic intervention strategies.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2013-CIG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)

Coordinatore

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI TRENTO
Contributo UE
€ 100 000,00
Indirizzo
VIA CALEPINA 14
38122 Trento
Italia

Mostra sulla mappa

Regione
Nord-Est Provincia Autonoma di Trento Trento
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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