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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Quantum Chemistry of Enzymatic Nucleophilic Substitution: Untangling the Role of Metal Ions and Protein Environment in Biochemical Nucleophilic Substitution at Phosphorus and Sulfur

Obiettivo

Enzymatic nucleophilic substitution reactions are ubiquitous as key steps in biochemical processes of living cells. Despite their importance, they are poorly understood, in particular regarding the exact mechanism and involvement of the protein environment and the role and mechanistic involvement of metal ions. Through interpretative methods from chemical reactivity theory, I will tackle the missing links in this field of molecular life sciences. This project thus goes beyond transition state calculations, which are today’s state of the art in computational enzymology, by addressing the question why. The project’s goal is to build a new research protocol to give insight in enzymatic reactions. This is original and innovative, and will as such contribute to Europe’s excellence. Through the integrated scientific and complementary skills training, it will offer much to my career development.
The role of metal ions and the protein environment in triphosphate hydrolysis and sulfur oxidation reactions, which are abundant and ubiquitous enzymatic reactions involved in e.g. signal and energy transduction will be untangled via quantitative molecular orbital (MO)-theory. The MO-model and its associated energy-decomposition approach, for which the host will offer a training, can make trends in reaction barriers transparent and is the current state of the art in explanatory chemistry. This approach is only marginally used to tackle the chemistry of enzymatic reactions and gives the project its originality and pioneering nature. Further, by studying the nature of the reaction barrier of sulfur oxidation reactions, I will pioneer the field of theoretical redox protein sulfur chemistry. Sulfur redox biology is being studied extensively by biochemists, but only marginally by theoreticians.
In conclusion, by studying representative proteins, this project translates fundamental chemical insights into biological relevance, giving the project its interdisciplinary nature.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2013-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

STICHTING VU
Contributo UE
€ 183 469,80
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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