Objectif
We use computational and analytical methods to study the factors that determine charge state of macromolecules in droplet, gaseous and bulk environments and the relation of the charge state to the conformations of the macromolecules. Practical applications of the study are found in electrospray mass spectrometry (ESMS), which is an analytical technique used for the analysis mainly of biological molecules such as proteins, DNA, poly-saccharides. To understand the processes that take place in electrospray ionization, knowledge of the charging and the conformations of a macromolecule is required in bulk, droplet environment and gaseous state.The factors that determine the charge state distribution of the macromolecules in the droplet include the interactions between the analyte and the solvent in the droplet environment, acidity changes in the droplet, evaporation rate of the solvent vs. deprotonation rate of the macroions in the droplet, release mechanisms of macroions from droplets, and details in the operation of the electrospray instrument. We use advanced molecular simulation methods to study rare molecular fluctuations in the solvent and macromolecules that are central in describing quantitatively the above processes. These rare fluctuations are captured by methods for study activated processes in statistical mechanics. The study aims at understanding fundamental processes in the charging of macromolecules and laying the theoretical foundation for processes that give rise to the signals in the ESMS methods. The computational methodology that we develop for the sampling of the conformational changes can be used in a broader class of problems than those we study. Moreover, our studies in the gas-droplet and bulk environment will enhance our knowledge on the interactions that determine the conformations of biological macromolecules.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
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- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-IIF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
CB2 1TN CAMBRIDGE
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.