Objectif
"Genome integrity is constantly challenged by endogenous and environmental factors that can induce different types of DNA lesions. Failure to repair DNA lesions can lead to genomic instability and contribute to human diseases such as cancer and premature ageing. To counteract these potentially devastating effects caused by DNA damage, eukaryotic cells have evolved complex DNA repair pathways. Protein ubiquitylation has emerged as an important regulatory mechanism of the cellular response to DNA damage: Ubiquitin-modifying enzymes are recruited to sites of DNA damage and are essential for the repair of DNA lesions. However, for most of these enzymes the protein substrates that are modified in response to DNA damage and the molecular functions in DNA damage signalling remain obscure.
Recent advances in mass spectrometry as well as novel methods for the enrichment of ubiquitylated peptides permit to systematically study protein ubiquitylation after cellular perturbations. In the proposed research project we plan to perform a quantitative analysis of protein ubiquitylation in ubiquitin ligase knockdown cells to identify the physiological substrates of ubiquitin ligases that function in DNA repair and chromatin organization. To this end, the cellular expression of selected ubiquitin ligases, including RAD18, BRCA1/BARD1, RNF20/40 and RING1A/RING1B/BMI1, will be downregulated by transient transfection of siRNA. Wildtype and knockdown cells will be treated with DNA damage-inducing agents and the ubiquitylation patterns in these cells will be comparatively analyzed using quantitative mass spectrometry. Biochemical and cell biological methods will be employed to characterize the physiological relevance of the site-specific protein ubiquitylation for the target proteins. These investigations are expected to uncover ubiquitin ligase – substrate relations and to deepen the understanding of the regulatory roles of ubiquitin ligases in processes that maintain chromatin integrity."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
55128 Mainz
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.