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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Towards a complete spatiotemporal model of viral morphogenesis during HIV maturation

Objectif

Viral morphogenesis, the phenomenon by which viruses reorganize their internal macromolecular structure in space and time across their lifecycle, is a complex process that is not quantitatively understood. HIV maturation, in particular, involves detailed atomistic processes such as protein-ligand recognition and cleavage that triggers large-scale macromolecular spatiotemporal rearrangement such as capsid self-assembly and RNA-modulated nucleocapsid condensation leading to infectious virus particles (virions) in a sequence of morphological changes that need to be carefully timed. Many antiretroviral inhibitors have been developed to stop maturation but their efficacy has been undermined by the emergence of drug resistant mutations. Furthermore, the effect of such inhibitors on the internal spatiotemporal viral dynamics is unknown. In order to quantitatively understand the determinants of maturation, inhibition and mutational resistance it is vital to construct a complete physics-based model of the maturation process. This requires detailed understanding of how all the relevant viral molecular constituents interact with each other at the atomistic level, how this is affected by drug interactions and mutations in proteins and how this carries over to the large-scale cleavage and self-assembly process. This project aims at deriving a multi-scale computer model of HIV maturation, integrating thermodynamic and kinetic binding data from massively parallel detailed molecular dynamics simulations of viral protein-protein and protein-drug interactions with particle-based reaction diffusion kinetics simulations describing the internal processing and remodeling in an entire virion explicitly in space and time. We will also investigate what happens if the morphological sequence is perturbed and use this to discover novel allosteric targets followed by implementing a high-throughput virtual and experimentally validated drug-screening program towards HIV eradication therapy.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2013-CIG
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)

Coordinateur

FREIE UNIVERSITAET BERLIN
Contribution de l’UE
€ 100 000,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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