Objetivo
The strategic directions of multidisciplinary research at the Institute of Oceanology of the Polish Academy of Sciences include genetics and molecular biology of marine organisms, fields of research where progress increasingly depends on expertise in computational biology. This project will allow making the first step in introducing this much-needed expertise in the Institute and indeed in the region, which we hope will benefit several projects at the Institute (molecular systematics of marine invertebrate s, population genetics of fish and molluscs, marine microbiology). However, considering the short timeline, the utility of tools developed during the project will first be tested on a dataset of Hepatitis C Virus sequences obtained from an epidemic with kn own infection history. These data allow constructing a true phylogenetic tree with extensive temporal information, as the times for both the external nodes and crucial internal nodes are known. HCV displays one the highest rates of evolution detected in an y life form (reaching 10-2 substitutions/site/year. Moreover, extreme heterogeneity of substitution rate is observed in some of the regions of HCV genome. The project will concentrate on resolving the following issues:
(1) the level of heterogeneity of the rate of substitution among sites,
(2) the use of complex models (for example, models which allow multiple substitution matrices) for possibly better description of the data,
(3) the effects of the presence of positive selection on the molecular clock,
(4) the nature of amino acid substitutions that occur, especially in the context of the quasispecies hypothesis and the possibility of multiple infections. By analysing sequences coming from a major human pathogen, we hope to provide insight into the molecular biology of HCV and other RNA viruses, relevant not only for molecular evolution, but also for molecular medicine, molecular epidemiology and forensics.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias naturales matemáticas matemáticas aplicadas estadística y probabilidad estadística bayesiana
- ciencias médicas y de la salud ciencias de la salud enfermedad infecciosa virus de ARN hepatitis C
- ciencias naturales ciencias químicas química orgánica aminas
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular evolución molecular
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2002-MOBILITY-11
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
SOPOT
Polonia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.