Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-05-29

Development of tools for the analysis of molecular clock and their application for a case of Hepatitis C Virus epidemics with known infection history

Cel

The strategic directions of multidisciplinary research at the Institute of Oceanology of the Polish Academy of Sciences include genetics and molecular biology of marine organisms, fields of research where progress increasingly depends on expertise in computational biology. This project will allow making the first step in introducing this much-needed expertise in the Institute and indeed in the region, which we hope will benefit several projects at the Institute (molecular systematics of marine invertebrate s, population genetics of fish and molluscs, marine microbiology). However, considering the short timeline, the utility of tools developed during the project will first be tested on a dataset of Hepatitis C Virus sequences obtained from an epidemic with kn own infection history. These data allow constructing a true phylogenetic tree with extensive temporal information, as the times for both the external nodes and crucial internal nodes are known. HCV displays one the highest rates of evolution detected in an y life form (reaching 10-2 substitutions/site/year. Moreover, extreme heterogeneity of substitution rate is observed in some of the regions of HCV genome. The project will concentrate on resolving the following issues:
(1) the level of heterogeneity of the rate of substitution among sites,
(2) the use of complex models (for example, models which allow multiple substitution matrices) for possibly better description of the data,
(3) the effects of the presence of positive selection on the molecular clock,
(4) the nature of amino acid substitutions that occur, especially in the context of the quasispecies hypothesis and the possibility of multiple infections. By analysing sequences coming from a major human pathogen, we hope to provide insight into the molecular biology of HCV and other RNA viruses, relevant not only for molecular evolution, but also for molecular medicine, molecular epidemiology and forensics.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

FP6-2002-MOBILITY-11
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

ERG - Marie Curie actions-European Re-integration Grants

Koordynator

INSTITUTE OF OCEANOLOGY, POLISH ACADEMY OF SCIENCES
Wkład UE
Brak danych
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych
Moja broszura 0 0