Safeguarding Cell Identities: Mechanisms Counteracting Cell Fate Reprogramming

Projektinformationen

REPROWORM

ID Finanzhilfevereinbarung: 637530

DOI 10.3030/637530

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 5 Februar 2015

Startdatum 1 März 2015

Enddatum 28 Februar 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 457 938,00

EU-Beitrag € 1 457 938,00

Koordiniert durch

MAX DELBRUECK CENTRUM FUER MOLEKULARE MEDIZIN IN DER HELMHOLTZ-GEMEINSCHAFT (MDC)
Germany

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (12)

The CONJUDOR pipeline for multiplexed knockdown of gene pairs identifies RBBP-5 as a germ cell reprogramming barrier in C. elegans

Autoren: Marlon Kazmierczak, Carlota Farré i Díaz, Andreas Ofenbauer, Sergej Herzog, Baris Tursun
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 49/4, 2020, Seite(n) e22-e22, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa1171

Increasing Notch signaling antagonizes PRC2-mediated silencing to promote reprograming of germ cells into neurons

Autoren: Stefanie Seelk, Irene Adrian-Kalchhauser, Balázs Hargitai, Martina Hajduskova, Silvia Gutnik, Baris Tursun, Rafal Ciosk
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 5, 2016, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.15477

FACT Sets a Barrier for Cell Fate Reprogramming in Caenorhabditis elegans and Human Cells

Autoren: Ena Kolundzic, Andreas Ofenbauer, Selman I. Bulut, Bora Uyar, Gülkiz Baytek, Anne Sommermeier, Stefanie Seelk, Mei He, Antje Hirsekorn, Dubravka Vucicevic, Altuna Akalin, Sebastian Diecke, Scott A. Lacadie, Baris Tursun
Veröffentlicht in: Developmental Cell, Ausgabe 46/5, 2018, Seite(n) 611-626.e12, ISSN 1534-5807
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2018.07.006

The conserved histone chaperone LIN‐53 is required for normal lifespan and maintenance of muscle integrity in Caenorhabditis elegans

Autoren: Stefanie Müthel, Bora Uyar, Mei He, Anne Krause, Burcu Vitrinel, Selman Bulut, Djordje Vasiljevic, Iris Marchal, Stefan Kempa, Altuna Akalin, Baris Tursun
Veröffentlicht in: Aging Cell, 2019, ISSN 1474-9718
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/acel.13012

MRG-1/MRG15 Is a Barrier for Germ Cell to Neuron Reprogramming in Caenorhabditis elegans

Autoren: Martina Hajduskova, Gülkiz Baytek, Ena Kolundzic, Alexander Gosdschan, Marlon Kazmierczak, Andreas Ofenbauer, Maria Lena Beato del Rosal, Sergej Herzog, Nida ul Fatima, Philipp Mertins, Stefanie Seelk-Müthel, Baris Tursun
Veröffentlicht in: Genetics, Ausgabe 211/1, 2019, Seite(n) 121-139, ISSN 0016-6731
Herausgeber: Genetics Society of America
DOI: 10.1534/genetics.118.301674

HOT or not: examining the basis of high-occupancy target regions

Autoren: Katarzyna Wreczycka, Vedran Franke, Bora Uyar, Ricardo Wurmus, Selman Bulut, Baris Tursun, Altuna Akalin
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 47/11, 2019, Seite(n) 5735-5745, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkz460

Strategies for in vivo reprogramming

Autoren: Andreas Ofenbauer, Baris Tursun
Veröffentlicht in: Current Opinion in Cell Biology, Ausgabe 61, 2019, Seite(n) 9-15, ISSN 0955-0674
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ceb.2019.06.002

Transdifferentiation: do transition states lie on the path of development?

Autoren: Anna Reid, Baris Tursun
Veröffentlicht in: Current Opinion in Systems Biology, Ausgabe 11, 2018, Seite(n) 18-23, ISSN 2452-3100
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coisb.2018.07.004

Determinants of promoter and enhancer transcription directionality in metazoans

Autoren: Mahmoud M. Ibrahim, Aslihan Karabacak, Alexander Glahs, Ena Kolundzic, Antje Hirsekorn, Alexa Carda, Baris Tursun, Robert P. Zinzen, Scott A. Lacadie, Uwe Ohler
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-06962-z

Application of RNAi and Heat-shock-induced Transcription Factor Expression to Reprogram Germ Cells to Neurons in <em>C. elegans</em>

Autoren: Ena Kolundzic, Stefanie Seelk, Baris Tursun
Veröffentlicht in: Journal of Visualized Experiments, Ausgabe 131, 2018, ISSN 1940-087X
Herausgeber: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/56889

Neuronal inhibition of the autophagy nucleation complex extends life span in post-reproductive C. elegans

Autoren: Thomas Wilhelm, Jonathan Byrne, Rebeca Medina, Ena Kolundžić, Johannes Geisinger, Martina Hajduskova, Baris Tursun, Holger Richly
Veröffentlicht in: Genes & Development, Ausgabe 31/15, 2017, Seite(n) 1561-1572, ISSN 0890-9369
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gad.301648.117

A tissue-specific protein purification approach in Caenorhabditis elegans identifies novel interaction partners of DLG-1/Discs large

Autoren: Selma Waaijers, Javier Muñoz, Christian Berends, João J. Ramalho, Soenita S. Goerdayal, Teck Y. Low, Adja D. Zoumaro-Djayoon, Michael Hoffmann, Thijs Koorman, Roderick P. Tas, Martin Harterink, Stefanie Seelk, Jana Kerver, Casper C. Hoogenraad, Olaf Bossinger, Baris Tursun, Sander van den Heuvel, Albert J. R. Heck, Mike Boxem
Veröffentlicht in: BMC Biology, Ausgabe 14/1, 2016, ISSN 1741-7007
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-016-0286-x

Book chapters (1)

PcG Proteins in Caenorhabditis elegans

Autoren: B. Tursun
Veröffentlicht in: Polycomb Group Proteins, 2017, Seite(n) 289-315, ISBN 9780-128097373
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/b978-0-12-809737-3.00012-x

Other (1)

FACT sets a barrier for cell fate reprogramming in C. elegans and Human

Autoren: Ena Kolundzic, Andreas Ofenbauer, Bora Uyar, Anne Sommermeier, Stefanie Seelk, Mei He, Guelkiz Baytek, Altuna Akalin, Sebastian Diecke, Scott Allen Lacadie, Baris Tursun
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2017
Herausgeber: CSHL
DOI: 10.1101/185116