Formation and Characterization of Protein Post-Translational Modifications and Assessment of Cellular Responses by Application of Metals in Biological Systems

Projektinformationen

METALS

ID Finanzhilfevereinbarung: 646603

DOI 10.3030/646603

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 8 Juni 2015

Startdatum 1 September 2015

Enddatum 28 Februar 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 798 750,00

EU-Beitrag € 1 798 750,00

Koordiniert durch

SYDDANSK UNIVERSITET
Denmark

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (17)

Elucidating the cellular response of silver nanoparticles as a potential combinatorial agent for cisplatin chemotherapy

Autoren: Renata Rank Miranda, Micaella Pereira da Fonseca, Barbara Korzeniowska, Lilian Skytte, Kaare Lund Rasmussen, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: Journal of Nanobiotechnology, Ausgabe 18/1, 2020, ISSN 1477-3155
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12951-020-00719-x

Cardiomyocyte Proteome Remodeling due to Isoproterenol‐Induced Cardiac Hypertrophy during the Compensated Phase

Autoren: Ricardo Cambraia Parreira, Diana Paola Gómez‐Mendoza, Itamar Couto Guedes Jesus, Rafael Pereira Lemos, Anderson Kennedy Santos, Cristiana Perdigão Rezende, Henrique César Pereira Figueiredo, Mauro Cunha Xavier Pinto, Frank Kjeldsen, Silvia Guatimosim, Rodrigo Ribeiro Resende, Thiago Verano‐Braga
Veröffentlicht in: PROTEOMICS – Clinical Applications, Ausgabe 14/4, 2020, Seite(n) 2000017, ISSN 1862-8346
Herausgeber: Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA
DOI: 10.1002/prca.202000017

PhosphoShield: Improving Trypsin Digestion of Phosphoproteins by Shielding the Negatively Charged Phosphate Moiety

Autoren: Julia A. Bubis, Vladimir Gorshkov, Mikhail V. Gorshkov, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2020, ISSN 1044-0305
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1021/jasms.0c00171

The Cytotoxicity of Metal Nanoparticles Depends on Their Synergistic Interactions

Autoren: Barbara Korzeniowska, Micaella P. Fonseca, Vladimir Gorshkov, Lilian Skytte, Kaare L. Rasmussen, Henrik D. Schrøder, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: Particle & Particle Systems Characterization, Ausgabe 37/8, 2020, Seite(n) 2000135, ISSN 0934-0866
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ppsc.202000135

SuperQuant-assisted comparative proteome analysis of glioblastoma subpopulations allows for identification of potential novel therapeutic targets and cell markers

Autoren: Thiago Verano-Braga, Vladimir Gorshkov, Sune Munthe, Mia D. Sørensen, Bjarne W. Kristensen, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: Oncotarget, Ausgabe 9/10, 2018, ISSN 1949-2553
Herausgeber: Impact Journals
DOI: 10.18632/oncotarget.24321

Comparative proteomics as a tool for identifying specific alterations within interferon response pathways in human glioblastoma multiforme cells

Autoren: Irina A Tarasova, Alesya V Tereshkova, Anna A Lobas, Elizaveta M Solovyeva, Alena S Sidorenko, Vladimir Gorshkov, Frank Kjeldsen, Julia A Bubis, Mark V Ivanov, Irina Y Ilina, Sergei A Moshkovskii, Peter M Chumakov, Mikhail V Gorshkov
Veröffentlicht in: Oncotarget, Ausgabe 9/2, 2018, ISSN 1949-2553
Herausgeber: Impact Journals
DOI: 10.18632/oncotarget.22751

Peptide de novo sequencing of mixture tandem mass spectra

Autoren: Vladimir Gorshkov, Stéphanie Yuki Kolbeck Hotta, Thiago Verano-Braga, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: PROTEOMICS, Ausgabe 16/18, 2016, Seite(n) 2470-2479, ISSN 1615-9853
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/pmic.201500549

Co-exposure to silver nanoparticles and cadmium induce metabolic adaptation in HepG2 cells

Autoren: Renata Rank Miranda, Vladimir Gorshkov, Barbara Korzeniowska, Stefan J. Kempf, Francisco Filipak Neto, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: Nanotoxicology, Ausgabe 12/7, 2018, Seite(n) 781-795, ISSN 1743-5390
Herausgeber: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17435390.2018.1489987

Toxicological interactions of silver nanoparticles and non-essential metals in human hepatocarcinoma cell line

Autoren: Renata Rank Miranda, Arandi Ginane Bezerra Jr, Ciro Alberto Oliveira Ribeiro, Marco Antônio Ferreira Randi, Carmen Lúcia Voigt, Lilian Skytte, Kaare Lund Rasmussen, Frank Kjeldsen, Francisco Filipak Neto
Veröffentlicht in: Toxicology in Vitro, Ausgabe 40, 2017, Seite(n) 134-143, ISSN 0887-2333
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tiv.2017.01.003

Uranyl photocleavage of phosphopeptides yields truncated C-terminally amidated peptide products

Autoren: Rasmus Linde Bang Elnegaard, Niels Erik Møllegaard, Qiang Zhang, Frank Kjeldsen, Thomas J.D. Jørgensen
Veröffentlicht in: ChemBioChem, 2017, ISSN 1439-4227
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.201700103

Ocular penetration of fluorometholone-loaded PEG-PLGA nanoparticles functionalized with cell-penetrating peptides

Autoren: Roberto Gonzalez-Pizarro, Graziella Parrotta, Rodrigo Vera, Elena Sánchez-López, Ruth Galindo, Frank Kjeldsen, Josefa Badia, Laura Baldoma, Marta Espina, María L García
Veröffentlicht in: Nanomedicine, Ausgabe 14/23, 2019, Seite(n) 3089-3104, ISSN 1743-5889
Herausgeber: Future Medicine Ltd.
DOI: 10.2217/nnm-2019-0201

DirectMS1: MS/MS-Free Identification of 1000 Proteins of Cellular Proteomes in 5 Minutes

Autoren: Mark V. Ivanov, Julia A. Bubis, Vladimir Gorshkov, Irina A. Tarasova, Lev I. Levitsky, Anna A. Lobas, Elizaveta M. Solovyeva, Marina L. Pridatchenko, Frank Kjeldsen, Mikhail V. Gorshkov
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, 2020, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.9b05095

Silver nanoparticle-induced expression of proteins related to oxidative stress and neurodegeneration in an in vitro human blood-brain barrier model

Autoren: Asif Manzoor Khan, Barbara Korzeniowska, Vladimir Gorshkov, Muhammad Tahir, Henrik Schrøder, Lilian Skytte, Kaare Lund Rasmussen, Surabhi Khandige, Jakob Møller-Jensen, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: Nanotoxicology, Ausgabe 13/2, 2019, Seite(n) 221-239, ISSN 1743-5390
Herausgeber: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17435390.2018.1540728

Protein corona formed on silver nanoparticles in blood plasma is highly selective and resistant to physicochemical changes of the solution

Autoren: Vladimir Gorshkov, Julia A. Bubis, Elizaveta M. Solovyeva, Mikhail V. Gorshkov, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: Environmental Science: Nano, Ausgabe 6/4, 2019, Seite(n) 1089-1098, ISSN 2051-8153
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c8en01054d

Angiotensin-(1-7) oral treatment after experimental myocardial infarction leads to downregulation of CXCR4

Autoren: Diana Paola Gómez-Mendoza, Fúlvia Dias Marques, Marcella Nunes Melo-Braga, Richard R. Sprenger, Rubén Dario Sinisterra, Frank Kjeldsen, Robson Augusto Santos, Thiago Verano-Braga
Veröffentlicht in: Journal of Proteomics, Ausgabe 208, 2019, Seite(n) 103486, ISSN 1874-3919
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jprot.2019.103486

Fast and Robust Proteome Screening Platform Identifies Neutrophil Extracellular Trap Formation in the Lung in Response to Cobalt Ferrite Nanoparticles

Autoren: Anja M. Billing, Kristina B. Knudsen, Andrew J. Chetwynd, Laura-Jayne A. Ellis, Selina V.Y. Tang, Trine Berthing, Håkan Wallin, Iseult Lynch, Ulla Vogel, Frank Kjeldsen
Veröffentlicht in: ACS Nano, 2020, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.9b08818

Rpn4 and proteasome-mediated yeast resistance to ethanol includes regulation of autophagy

Autoren: Julia A. Bubis, Daria S. Spasskaya, Vladimir A. Gorshkov, Frank Kjeldsen, Aleksandra M. Kofanova, Dmitry S. Lekanov, Mikhail V. Gorshkov, Vadim L. Karpov, Irina A. Tarasova, Dmitry S. Karpov
Veröffentlicht in: Applied Microbiology and Biotechnology, 2020, ISSN 0175-7598
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00253-020-10518-x