Protein design from sub-domain sized fragments

Informazioni relative al progetto

Protein Lego

ID dell’accordo di sovvenzione: 647548

DOI

10.3030/647548

Progetto chiuso

Data della firma CE 31 Marzo 2015

Data di avvio 1 Settembre 2015

Data di completamento 31 Agosto 2021

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 950 000,00

Contributo UE

€ 1 950 000,00

Coordinato da

UNIVERSITAT BAYREUTH
Germany

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (8)

The Stability Landscape of de novo TIM Barrels Explored by a Modular Design Approach

Autori: Sergio Romero-Romero, Miguel Costas, Daniel-Adriano Silva Manzano, Sina Kordes, Erendira Rojas-Ortega, Cinthya Tapia, Yasel Guerra, Sooruban Shanmugaratnam, Adela Rodríguez-Romero, David Baker, Birte Höcker, D. Alejandro Fernández-Velasco
Pubblicato in: Journal of Molecular Biology, Numero 433/18, 2021, Pagina/e 167153, ISSN 0022-2836
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2021.167153

ProteinTools: a toolkit to analyze protein structures

Autori: Noelia Ferruz, Steffen Schmidt, Birte Höcker
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 49/W1, 2021, Pagina/e W559-W566, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab375

Strategies for designing non-natural enzymes and binders

Autori: Horst Lechner, Noelia Ferruz, Birte Höcker
Pubblicato in: Current Opinion in Chemical Biology, Numero 47, 2018, Pagina/e 67-76, ISSN 1367-5931
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2018.07.022

Reconstructing the Remote Origins of a Fold Singleton from a Flavodoxin-Like Ancestor

Autori: Saacnicteh Toledo-Patiño, Manish Chaubey, Murray Coles, Birte Höcker
Pubblicato in: Biochemistry, Numero 58/48, 2019, Pagina/e 4790-4793, ISSN 0006-2960
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.biochem.9b00900

Identification and Analysis of Natural Building Blocks for Evolution-Guided Fragment-Based Protein Design

Autori: Noelia Ferruz, Francisco Lobos, Dominik Lemm, Saacnicteh Toledo-Patino, José Arcadio Farías-Rico, Steffen Schmidt, Birte Höcker
Pubblicato in: Journal of Molecular Biology, 2020, ISSN 0022-2836
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2020.04.013

Fuzzle 2.0: Ligand Binding in Natural Protein Building Blocks

Autori: Noelia Ferruz, Florian Michel, Francisco Lobos, Steffen Schmidt, Birte Höcker
Pubblicato in: Frontiers in Molecular Biosciences, Numero 8, 2021, ISSN 2296-889X
Editore: Frontiers Media S.A..
DOI: 10.3389/fmolb.2021.715972

Evolution, folding, and design of TIM barrels and related proteins

Autori: Sergio Romero-Romero, Sina Kordes, Florian Michel, Birte Höcker
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, Numero 68, 2021, Pagina/e 94-104, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.12.007

Protlego: A Python package for the analysis and design of chimeric proteins

Autori: Noelia Ferruz; Jakob Noske; Birte Hoecker
Pubblicato in: Bioinformatics, 2021, ISSN 1367-4803
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2020.10.04.325555