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Revealing Allele-level Regulation and Dynamics using Single-cell Gene Expression Analyses

Obiettivo

As diploid organisms inherit one gene copy from each parent, a gene can be expressed from both alleles (biallelic) or from only one allele (monoallelic). Although transcription from both alleles is detected for most genes in cell population experiments, little is known about allele-specific expression in single cells and its phenotypic consequences. To answer fundamental questions about allelic transcription heterogeneity in single cells, this research program will focus on single-cell transcriptome analyses with allelic-origin resolution. To this end, we will investigate both clonally stable and dynamic random monoallelic expression across a large number of cell types, including cells from embryonic and adult stages. This research program will be accomplished with the novel single-cell RNA-seq method developed within my lab to obtain quantitative, genome-wide gene expression measurement. To distinguish between mitotically stable and dynamic patterns of allelic expression, we will analyze large numbers a clonally related cells per cell type, from both primary cultures (in vitro) and using transgenic models to obtain clonally related cells in vivo.

The biological significance of the research program is first an understanding of allelic transcription, including the nature and extent of random monoallelic expression across in vivo tissues and cell types. These novel insights into allelic transcription will be important for an improved understanding of how variable phenotypes (e.g. incomplete penetrance and variable expressivity) can arise in genetically identical individuals. Additionally, the single-cell transcriptome analyses of clonally related cells in vivo will provide unique insights into the clonality of gene expression per se.

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-COG - Consolidator Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2014-CoG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

KAROLINSKA INSTITUTET
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 923 060,00
Indirizzo
NOBELS VAG 5
171 77 STOCKHOLM
Svezia

Mostra sulla mappa

Regione
Östra Sverige Stockholm Stockholms län
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 923 060,00

Beneficiari (1)

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