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COuNt data TimE SerieS Analysis: significance tests and sequencing data application

Obiettivo

The aim of this project is to develop methods for analysis of time-series based on count data. For example, detecting significant differences between two count data time series would distinguish between two different models: one in which the two time series are interchangeable, and one in which the second sample is a modification of the first, i.e. the two time series are non-interchangeable. This will broaden the target of my project to general analysis of count time-series data such as clustering, classification, perturbations inference and machine learning over sequential count data. The project will focus on count data sets from ribonucleic acid sequencing (RNA-seq) time course experiments. The method I plan to develop potentially has promising applications in a variety of multidisciplinary fields where event-counting is required, such as economics and biology. In economics, examples include the number of applicants for a job, or the number of labour strikes during a year. In biology, recent examples include high-throughput sequencing, such as RNA-seq and chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) analyses. These examples are especially relevant to this project because the method I will be developing enables various features of organisms to be compared through tag counts.

I am enthusiastic about having the opportunity to be instrumental to a field where once developed this project will have a
real impact in finding better treatments for patients with neurodegenerative diseases including amyotrophic lateral sclerosis (ALS), Alzheimer’s and Parkinson’s Disease. Professor Neil Lawrence will act as the supervisor of the fellowship and will take over responsibility for my training and development. My fellowship experience will be enriched further through a six month secondment period at University of Manchester with Professor Magnus Rattray and through the opportunity to collaborate with SITraN’s Professor Winston Hide and Biogen Idec Industry.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2014

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

THE UNIVERSITY OF SHEFFIELD
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 195 454,80
Indirizzo
FIRTH COURT WESTERN BANK
S10 2TN Sheffield
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
Yorkshire and the Humber South Yorkshire Sheffield
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 195 454,80
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