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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Dissecting microbiome and immune interactions in human intestinal (cancer) organoids

Projektbeschreibung

Mini-Darm modelliert Interaktionen zwischen Mikrobiota und Darm

Darmstammzellen regenerieren und reparieren kontinuierlich das Darmepithel, das aufgrund der rauen Bedingungen und mechanischen Belastungen im Verdauungssystem einem ständigen Wandel unterliegt. Durch umfangreiche Forschungsarbeiten wurden im Laufe der Jahre Signalwege und Zielgene identifiziert, die für die Funktion und die Eigenschaften von Darmstammzellen eine zentrale Rolle spielen. Dank dieser Informationen konnten Forschende des Projekts Organoid Darmtrakte in Miniatur erzeugen, die ähnliche Eigenschaften wie ein normaler Darm aufweisen. Das vom Europäischen Forschungsrat finanzierte Projekt zielt darauf ab, die Wechselwirkungen zwischen dem Darmmikrobiom und dem Darmepithel zu untersuchen. Die Technologie wird erweitert, um Organoide von Darmkrebs herzustellen und die Wechselwirkungen mit dem Immunsystem zu untersuchen.

Ziel

We pioneered the essential role of Wnt signals in adult stem cells, i.e. in intestinal crypts. We also found that loss of the APC gene activates the Wnt pathway and causes colorectal cancer (CRC). We then identified a Wnt target gene, Lgr5, which allowed us to define the crypt stem cells. In a previous ERC grant based on these findings, we identified novel Lgr5 stem cells in multiple organs, and defined in vitro culture conditions to grow epithelial organoids from single Lgr5 stem cells. Crucial in this was our identification of the Wnt agonistic R-spondins as the Lgr5 ligands. Cultured 'mini-guts' display all characteristics of normal gut, can be expanded for years, transplanted, and remain genetically stable.

Here, I propose a reductionist, ‘mini-gut’-based approach to two exciting research fields that currently mostly focus at the organismal/patient level: Microbiome research leans on deep-sequencing of complex microbial communities in health and disease; and immune checkpoint research in cancer rests largely on clinical trials of checkpoint-blocking antibodies. While many insights exist into the gut microbiome and -immune system, the epithelium is often treated as a neutral player. ‘Mini-gut’ technology allows us to dissect interactions of the gut microbiome with healthy and diseased epithelium, and of Tumor-Infiltrating Lymphocytes (TILs) with CRC 'mini-guts' (tumoroids).

To this end, we will describe/study
1) All immune receptors, -regulators and -effectors in the individual epithelial cell types.
2) 'Mini-guts' recombined with individual bacterial species,
3) CRC tumoroids recombined with their cultured TILs and subjected to immune checkpoint manipulation.
Using advanced molecular and imaging technologies, we will chart the molecular mechanisms that underlie the interactions from the ‘epithelial perspective’. Ultimately, this program will provide molecular detail to the effects of the microbiome and immune system on our gut, in health and disease.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

ERC-ADG - Advanced Grant

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2014-ADG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

KONINKLIJKE NEDERLANDSE AKADEMIE VAN WETENSCHAPPEN - KNAW
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 3 062 438,00
Adresse
KLOVENIERSBURGWAL 29 HET TRIPPENHUIS
1011 JV AMSTERDAM
Niederlande

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Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 3 062 438,00

Begünstigte (1)

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