A Minimal-Tag Bioorthogonal Labelling Approach to Protein Uptake, Traffic and Delivery

Informations projet

TagIt

N° de convention de subvention: 676832

DOI

10.3030/676832

Projet clôturé

Date de signature de la CE 8 Juillet 2016

Date de début 1 Octobre 2016

Date de fin 31 Mars 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 499 106,00

Contribution de l’UE

€ 1 499 106,00

Coordonné par

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

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Publications

Non-peer reviewed articles (1)

Strategies for Conditional Regulation of Proteins

Auteurs: Karthik Nadendla; Grant G. Simpson; Julie Becher; Toby Journeaux; Mar Cabeza-Cabrerizo; Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Crossref, Numéro 1, 2023, ISSN 2691-3704
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacsau.2c00654

Peer reviewed articles (36)

The use of fluoroproline in MUC1 antigen enables efficient detection of antibodies in patients with prostate cancer

Auteurs: Somovilla, V., Bermejo, I., Albuquerque, I., Martínez-Sáez, N., Castro-López, J., García-Martín, F., Compañón, I., Hinou, H., Nishimura, S., Jiménez-Barbero, J., Asensio, J., Avenoza, A., Busto, Hurtado-Guerrero, R., Peregrina, J., Lopes Bernardes, G., & Corzana, F.
Publié dans: J. Am. Chem. Soc., 2017, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.7b09447

Site-selective installation of an electrophilic handle on proteins for bioconjugation

Auteurs: Lee, B., Sun, S., Jiménez-Moreno, E., Neves, A. A., & Bernardes, G. J.
Publié dans: Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2018, ISSN 0968-0896
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.bmc.2018.02.028

Stable Pyrrole-Linked Bioconjugates through Tetrazine-Triggered Azanorbornadiene Fragmentation.

Auteurs: Gil De Montes, Enrique; Istrate, Alena; Navo, Claudio D; Jiménez-Moreno, Ester; Hoyt, Emily A; Corzana, Francisco; Robina, Inmaculada; Jiménez-Osés, Gonzalo; Moreno-Vargas, Antonio J; Bernardes, Gonçalo JL
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 2, 2020, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201914529

Arylethynyltrifluoroborate Dienophiles for on Demand Activation of IEDDA Reactions

Auteurs: Zbigniew Zawada; Zijian Guo; Bruno L. Oliveira; Bruno L. Oliveira; Claudio D. Navo; He Li; Pedro M. S. D. Cal; Francisco Corzana; Gonzalo Jiménez-Osés; Gonçalo J. L. Bernardes; Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Bioconjugate Chemistry, Numéro 4, 2021, ISSN 1520-4812
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.1c00276

Protein modification via alkyne hydrosilylation using a substoichiometric amount of ruthenium(ii) catalyst

Auteurs: Kwan, T. T.-L., Boutureira, O., Frye, E. C., Walsh, S. J., Gupta, M. K., Wallace, S., Wu, Y., Zhang, F., Sore, H. F., Galloway, W. R. J. D., Chin, J. W., Welch, M., Bernardes, G. J. L., Spring, D. R.
Publié dans: Chemical Science, 2017, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c6sc05313k

Controlled In-Cell Generation of Active Palladium(0) Species for Bioorthogonal Decaging.

Auteurs: Juraj Konč; Valerio Sabatino; Ester Jiménez-Moreno; Eloah Latocheski; Laura Rodríguez Pérez; Jason Day; Josiel B. Domingos; Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 4, 2021, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202113519

Site-selective installation of BASHY fluorescent dyes to Annexin V for targeted detection of apoptotic cells

Auteurs: Cal, P. M. S. D., Sieglitz, F., Santos, F. M. F., Parente Carvalho, C., Guerreiro, A., Bertoldo, J. B., Pischel, U., Gois, P. M. P., Bernardes, G. J. L.
Publié dans: Chemical Communications, 2017, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c6cc08671c

Enhanced Permeability and Binding Activity of Isobutylene-Grafted Peptides

Auteurs: Sun, S., Compañón, I., Martínez‐Sáez, N., Seixas, J. D., Boutureira, O., Corzana, F., & Bernardes, G. J. L.
Publié dans: ChemBioChem, 2017, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.201700586

Natural product modulators of transient receptor potential (TRP) channels as potential anti-cancer agents

Auteurs: Tiago Rodrigues, Florian Sieglitz, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Chemical Society Reviews, 2016, ISSN 0306-0012
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c5cs00916b

Oxidative Activation of C-S Bonds with an Electropositive Nitrogen Promoter Enables Orthogonal Glycosylation of Alkyl over Phenyl Thioglycosides

Auteurs: Kitowski, A., Jiménez-Moreno, E., Salvadó, M., Mestre, J., Castillón, S., Jiménez-Osés, G., Boutureira, O., & Bernardes, G. J.
Publié dans: Organic Letters, 2017, ISSN 1523-7060
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.orglett.7b02886

Site-Selective Modification of Proteins with Oxetanes

Auteurs: Boutureira, O., Martínez‐Sáez, N., Brindle, K. M., Neves, A. A., Corzana, F., & Bernardes, G. J. L.
Publié dans: Chemistry – A European Journal, 2017, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.201700745

A Fluorogenic Probe for Cell Surface Phosphatidylserine Using an Intramolecular Indicator Displacement Sensing Mechanism

Auteurs: Zwicker, V. E., Oliveira, B. L., Yeo, J. H., Fraser, S. T., Bernardes, G. J., New, E. J., & Jolliffe, K. A.
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, 2019, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201812489

Trends in therapeutic drug conjugates for bacterial diseases: a patent review

Auteurs: Cal, P., Matos, M., Bernardes, G.
Publié dans: Expert Opinion on Therapeutic Patents, 2017, ISSN 1354-3776
Éditeur: Ashley Publications Ltd.
DOI: 10.1080/13543776.2017.1259411

Inverse electron demand Diels–Alder reactions in chemical biology

Auteurs: B. L. Oliveira, Z. Guo, G. J. L. Bernardes
Publié dans: Chemical Society Reviews, Numéro 46/16, 2017, Page(s) 4895-4950, ISSN 0306-0012
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c7cs00184c

Chemoselective Installation of Amine Bonds on Proteins through Aza-Michael Ligation

Auteurs: Allyson M. Freedy, Maria J. Matos, Omar Boutureira, Francisco Corzana, Ana Guerreiro, Padma Akkapeddi, Víctor J. Somovilla, Tiago Rodrigues, Karl Nicholls, Bangwen Xie, Gonzalo Jiménez-Osés, Kevin M. Brindle, André A. Neves, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 139/50, 2017, Page(s) 18365-18375, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.7b10702

A Minimal, Unstrained S-Allyl Handle for Pre-Targeting Diels-Alder Bioorthogonal Labeling in Live Cells

Auteurs: Bruno L. Oliveira, Zijian Guo, Omar Boutureira, Ana Guerreiro, Gonzalo Jiménez-Osés, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 55/47, 2016, Page(s) 14683-14687, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201608438

Stoichiometric and irreversible cysteine-selective protein modification using carbonylacrylic reagents

Auteurs: Barbara Bernardim, Pedro M.S.D. Cal, Maria J. Matos, Bruno L. Oliveira, Nuria Martínez-Sáez, Inês S. Albuquerque, Elizabeth Perkins, Francisco Corzana, Antonio C.B. Burtoloso, Gonzalo Jiménez-Osés, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Nature Communications, Numéro 7, 2016, Page(s) 13128, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms13128

Quaternization of Vinyl/Alkynyl Pyridine Enables Ultrafast Cysteine-Selective Protein Modification and Charge Modulation

Auteurs: Maria J. Matos, Claudio D. Navo, Tuuli Hakala, Xhenti Ferhati, Ana Guerreiro, David Hartmann, Barbara Bernardim, Kadi L. Saar, Ismael Compañón, Francisco Corzana, Tuomas P. J. Knowles, Gonzalo Jiménez-Osés, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 58/20, 2019, Page(s) 6640-6644, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201901405

Chemo- and Regioselective Lysine Modification on Native Proteins

Auteurs: Maria J. Matos, Bruno L. Oliveira, Nuria Martínez-Sáez, Ana Guerreiro, Pedro M. S. D. Cal, Jean Bertoldo, María Maneiro, Elizabeth Perkins, Julie Howard, Michael J. Deery, Justin M. Chalker, Francisco Corzana, Gonzalo Jiménez-Osés, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 140/11, 2018, Page(s) 4004-4017, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.7b12874

A fully human anti-IL-7Rα antibody promotes antitumor activity against T-cell acute lymphoblastic leukemia

Auteurs: Padma Akkapeddi, Rita Fragoso, Julie A. Hixon, Ana Sofia Ramalho, Mariana L. Oliveira, Tânia Carvalho, Andreas Gloger, Mattia Matasci, Francisco Corzana, Scott K. Durum, Dario Neri, Gonçalo J. L. Bernardes, João T. Barata
Publié dans: Leukemia, Numéro 33/9, 2019, Page(s) 2155-2168, ISSN 0887-6924
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41375-019-0434-8

Azabicyclic vinyl sulfones for residue-specific dual protein labelling

Auteurs: Enrique Gil de Montes, Ester Jiménez-Moreno, Bruno L. Oliveira, Claudio D. Navo, Pedro M. S. D. Cal, Gonzalo Jiménez-Osés, Inmaculada Robina, Antonio J. Moreno-Vargas, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Chemical Science, Numéro 10/16, 2019, Page(s) 4515-4522, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c9sc00125e

Ethynylbenziodoxolone Reactivity in Cysteine Bioconjugation

Auteurs: Srinivasa Rao Adusumalli, Gonçalo J.L. Bernardes
Publié dans: Chem, Numéro 5/8, 2019, Page(s) 1932-1934, ISSN 2451-9294
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chempr.2019.07.014

Spontaneous CO release from Ru(II)(CO)2-protein complexes in aqueous solution, cells, and mice

Auteurs: Miguel Chaves-Ferreira, Inês S. Albuquerque, Dijana Matak-Vinkovic, Ana C. Coelho, Sandra M. Carvalho, Lígia M. Saraiva, Carlos C. Romão, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, 2015, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201409344

Chemo- and Regioselective Lysine Modification on Native Proteins.

Auteurs: Matos, Maria J; Oliveira, Bruno L; Martínez-Sáez, Nuria; Guerreiro, Ana; Cal, Pedro MSD; Bertoldo, Jean; Maneiro, María; Perkins, Elizabeth; Howard, Julie; Deery, Michael J; Chalker, Justin M; Corzana, Francisco; Jiménez-Osés, Gonzalo; Bernardes, Gonçalo JL
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 12, 2018, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.17863/cam.22987

A silicon-labelled amino acid suitable for late-stage fluorination and unexpected oxidative cleavage reactions in the preparation of a key intermediate in the Strecker synthesis

Auteurs: Kymberley R. Scroggie, Lisa J. Alcock, Maria J. Matos, Gonçalo J. L. Bernardes, Michael V. Perkins, Justin M. Chalker
Publié dans: Peptide Science, 2018, Page(s) e24069, ISSN 2475-8817
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc
DOI: 10.1002/pep2.24069

A Water-Bridged Cysteine-Cysteine Redox Regulation Mechanism in Bacterial Protein Tyrosine Phosphatases

Auteurs: Jean B. Bertoldo; Jean B. Bertoldo; Tiago Rodrigues; Lavinia Dunsmore; Francesco A. Aprile; Marta C. Marques; Leonardo Astolfi Rosado; Omar Boutureira; Thomas Steinbrecher; Woody Sherman; Francisco Corzana; Hernán Terenzi; Gonçalo J. L. Bernardes; Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Chem, Numéro 10, 2017, ISSN 2451-9294
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.chempr.2017.07.009

Controlled masking and targeted release of redox-cycling ortho-quinones via a C–C bond-cleaving 1,6-elimination

Auteurs: Lavinia Dunsmore, Claudio D. Navo, Julie Becher, Enrique Gil de Montes, Ana Guerreiro, Emily Hoyt, Libby Brown, Viviane Zelenay, Sigitas Mikutis, Jonathan Cooper, Isaia Barbieri, Stefanie Lawrinowitz, Elise Siouve, Esther Martin, Pedro R. Ruivo, Tiago Rodrigues, Filipa P. da Cruz, Oliver Werz, George Vassiliou, Peter Ravn, Gonzalo Jiménez-Osés, Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Nature Chemistry, 2022, ISSN 1755-4330
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41557-022-00964-7

Radical-Mediated Thiol-Ene Strategy: Photoactivation of Thiol-Containing Drugs in Cancer Cells.

Auteurs: Shuang Sun; Bruno L. Oliveira; Gonzalo Jiménez-Osés; Gonçalo J. L. Bernardes; Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 5, 2018, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201811338

Bioorthogonal Strategy for Bioprocessing of Specific-Site-Functionalized Enveloped Influenza-Virus-Like Particles

Auteurs: Carvalho, S. B., Freire, J. M., Moleirinho, M. G., Monteiro, F., Gaspar, D., Castanho, M. A. R. B., Carrondo, M. J. T., Alves, P. M., Bernardes, G. J. L., & Peixoto, C.
Publié dans: Bioconjugate Chemistry, 2016, ISSN 1043-1802
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.6b00372

Oxetane grafts site-selectively installed on native disulfides enhance protein stability and activity in vivo

Auteurs: Martínez‐Sáez, N., Sun, S., Oldrini, D., Sormanni, P., Boutureira, O., Carboni, F., Compañón, I., Deery, M. J., Vendruscolo, M., Corzana, F., Adamo, R., & Bernardes, G. J. L.
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, 2017, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201708847

Norbornene probes for the study of cysteine oxidation

Auteurs: Alcock, L. J., Farrell, K. D., Akol, M. T., Jones, G. H., Tierney, M. M., Kramer, H. B., Pukala, T. L., Bernardes, G. J. L., Perkins, M. V., & Chalker, J. M.
Publié dans: ACS Chemical Biology, 2019, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.8b01104

Vinyl Ether/Tetrazine Pair for the Traceless Release of Alcohols in Cells

Auteurs: Jiménez‐Moreno, E., Guo, Z., Oliveira, B. L., Albuquerque, I. S., Kitowski, A., Guerreiro, A., Boutureira, O., Rodrigues, T., Jiménez‐Osés, G., & Bernardes, G. J. L.
Publié dans: Angewandte Chemie, 2016, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201609607

Laying Waste to Mercury: Inexpensive Sorbents Made from Sulfur and Recycled Cooking Oils

Auteurs: Worthington, M. J. H., Kucera, R. L., Albuquerque, I. S., Gibson, C. T., Sibley, A., Slattery, A. D., Campbell, J. A., Alboaiji, S. F. K., Muller, K. A., Young, J., Adamson, N., Gascooke, J. R., Jampaiah, D., Sabri, Y. M., Bhargava, S. K., Ippolito, S. J., Lewis, D. A., Quinton, J. S., Ellis, A. V., Johs, A., Bernardes, G. J. L., Chalker, J. M.
Publié dans: Chemistry — A European Journal, 2017, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.201702871

De novo design of potent and selective mimics of IL-2 and IL-15

Auteurs: Daniel-Adriano Silva; Shawn Yu; Umut Ulge; Jamie B. Spangler; Jamie B. Spangler; Kevin Jude; Carlos Labão-Almeida; Lestat R. Ali; Alfredo Quijano-Rubio; Mikel Ruterbusch; Isabel Leung; Tamara Biary; Stephanie J. Crowley; Enrique Marcos; Carl Walkey; Brian D. Weitzner; Fátima Pardo-Avila; Javier Castellanos; Lauren Carter; Lance Stewart; Stanley R. Riddell; Marion Pepper; Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Nature, Numéro 10, 2019, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0830-7

A Platform for Site-Specific DNA-Antibody Bioconjugation by Using Benzoylacrylic-Labelled Oligonucleotides

Auteurs: Juraj Konč; Libby Brown; Daniel R. Whiten; Yukun Zuo; Peter Ravn; Peter Ravn; David Klenerman; Gonçalo J. L. Bernardes; Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 1, 2021, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202109713

Platinum-Triggered Bond-Cleavage of Pentynoyl Amide and N-Propargyl Handles for Drug-Activation

Auteurs: Bruno L. Oliveira; Bruno L. Oliveira; Benjamin J Stenton; V B Unnikrishnan; Cátia Rebelo de Almeida; João Conde; Magda Negrão; Felipe S. S. Schneider; Carlos Cordeiro; Miguel Godinho Ferreira; Giovanni F. Caramori; Josiel B. Domingos; Rita Fior; Gonçalo J. L. Bernardes; Gonçalo J. L. Bernardes
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 15, 2020, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.0c01622