Building Next-Generation Computational Tools for High Resolution Neuroimaging Studies

Thalamic white matter macrostructure and subnuclei volumes in Parkinson’s disease depression

Autoren: R. Bhome, A. Zarkali, G. E. C. Thomas, J. E. Iglesias, J. H. Cole, R. S. Weil
Veröffentlicht in: npj Parkinson's Disease, 2022, ISSN 2373-8057
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41531-021-00270-y

Joint super-resolution and synthesis of 1 mm isotropic MP-RAGE volumes from clinical MRI exams with scans of different orientation, resolution and contrast

Autoren: 9. Iglesias JE, Billot B, Balbastre Y, Tabari A, Conklin J, RG Gonzalez, Alexander DC, Golland P, Edlow B, Fischl B
Veröffentlicht in: NeuroImage, 2021, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2021.118206

Infant FreeSurfer: An automated segmentation and surface extraction pipeline for T1-weighted neuroimaging data of infants 0–2 years

Autoren: Lilla Zöllei, Juan Eugenio Iglesias, Yangming Ou, P. Ellen Grant, Bruce Fischl
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 218, 2020, Seite(n) 116946, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2020.116946

SynthMorph: learning contrast-invariant registration without acquired images

Autoren: Malte Hoffmann; Benjamin Billot; Douglas N. Greve; Juan Eugenio Iglesias; Bruce Fischl; Adrian V. Dalca
Veröffentlicht in: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2022, ISSN 0278-0062
Herausgeber: Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI: 10.1109/tmi.2021.3116879

Automated Brainstem Segmentation Detects Differential Involvement in Atypical Parkinsonian Syndromes

Autoren: Martina Bocchetta, Juan Eugenio Iglesias, Viorica Chelban, Edwin Jabbari, Ruth Lamb, Lucy L. Russell, Caroline V. Greaves, Mollie Neason, David M. Cash, David L. Thomas, Jason D. Warren, John Woodside, Henry Houlden, Huw R. Morris, Jonathan D. Rohrer
Veröffentlicht in: Journal of Movement Disorders, Ausgabe 13/1, 2020, Seite(n) 39-46, ISSN 2005-940X
Herausgeber: e-jmd.org
DOI: 10.14802/jmd.19030

Test-retest reliability of FreeSurfer automated hippocampal subfield segmentation within and across scanners

Autoren: Emma M. Brown, Meghan E. Pierce, Dustin C. Clark, Bruce R. Fischl, Juan E. Iglesias, William P. Milberg, Regina E. McGlinchey, David H. Salat
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 210, 2020, Seite(n) 116563, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2020.116563

A deep learning toolbox for automatic segmentation of subcortical limbic structures from MRI images

Autoren: Douglas N Greve, BenjaminBillot, Devani Cordero, Andrew Hoopes, Malte Hoffmanna, Adrian V Dalca. Bruce Fischl, uan Eugenio Iglesias, Jean C.Augustinack
Veröffentlicht in: NeuroImage, 2021, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2021.118610

Uncertainty-Aware Annotation Protocol to Evaluate Deformable Registration Algorithms

Autoren: Loïc Peter; Daniel C. Alexander; Caroline Magnain; Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2021, ISSN 0278-0062
Herausgeber: Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI: 10.1109/tmi.2021.3070842

Quantification of volumetric morphometry and optical property in the cortex of human cerebellum at micrometer resolution.

Autoren: Chao J. Liu; William Ammon; Viviana Siless; Morgan Fogarty; Ruopeng Wang; Alessia Atzeni; Iman Aganj; Juan Eugenio Iglesias; Lilla Zöllei; Bruce Fischl; Jeremy D. Schmahmann; Hui Wang
Veröffentlicht in: NeuroImage, Vol 244, Iss , Pp 118627- (2021), 2021, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2021.118627

A Survey of Methods for 3D Histology Reconstruction

Autoren: Jonas Pichat, Juan Eugenio Iglesias, Tarek Yousry, Sébastien Ourselin, Marc Modat
Veröffentlicht in: Medical Image Analysis, 2018, ISSN 1361-8415
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.media.2018.02.004

Probabilistic visual and electromagnetic data fusion for robust drift-free sequential mosaicking: application to fetoscopy

Autoren: Marcel Tella-Amo, Loic Peter, Dzhoshkun I. Shakir, Jan Deprest, Danail Stoyanov, Juan Eugenio Iglesias, Tom Vercauteren, Sebastien Ourselin
Veröffentlicht in: Journal of Medical Imaging, Ausgabe 5/02, 2018, Seite(n) 1, ISSN 2329-4302
Herausgeber: SPIE Digital library
DOI: 10.1117/1.JMI.5.2.021217

High-resolution magnetic resonance imaging reveals nuclei of the human amygdala: manual segmentation to automatic atlas

Autoren: Z.M. Saygin, D. Kliemann, J.E. Iglesias, A.J.W. van der Kouwe, E. Boyd, M. Reuter, A. Stevens, K. Van Leemput, A. McKee, M.P. Frosch, B. Fischl, J.C. Augustinack
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 155, 2017, Seite(n) 370-382, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2017.04.046

Mid-space-independent deformable image registration

Autoren: Iman Aganj, Juan Eugenio Iglesias, Martin Reuter, Mert Rory Sabuncu, Bruce Fischl
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 152, 2017, Seite(n) 158-170, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2017.02.055

A magnetic resonance multi-atlas for the neonatal rabbit brain

Autoren: Sebastiano Ferraris, Johannes van der Merwe, Lennart Van Der Veeken, Ferran Prados, Juan-Eugenio Iglesias, Andrew Melbourne, Marco Lorenzi, Marc Modat, Willy Gsell, Jan Deprest, Tom Vercauteren
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 179, 2018, Seite(n) 187-198, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2018.06.029

Amygdala subnuclei are differentially affected in the different genetic and pathological forms of frontotemporal dementia

Autoren: Martina Bocchetta, Juan Eugenio Iglesias, David M. Cash, Jason D. Warren, Jonathan D. Rohrer
Veröffentlicht in: Alzheimer's & Dementia: Diagnosis, Assessment & Disease Monitoring, Ausgabe 11, 2019, Seite(n) 136-141, ISSN 2352-8729
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.dadm.2018.12.006

Smaller hippocampal CA1 subfield volume in posttraumatic stress disorder

Autoren: Lyon W. Chen, Delin Sun, Sarah L. Davis, Courtney C. Haswell, Emily L. Dennis, Chelsea A. Swanson, Christopher D. Whelan, Boris Gutman, Neda Jahanshad, Juan Eugenio Iglesias, Paul Thompson, H. Ryan Wagner, Philipp Saemann, Kevin S. LaBar, Rajendra A. Morey
Veröffentlicht in: Depression and Anxiety, Ausgabe 35/11, 2018, Seite(n) 1018-1029, ISSN 1091-4269
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/da.22833

Primum non nocere: a call for balance when reporting on CTE

Autoren: William Stewart, Kieren Allinson, Safa Al-Sarraj, Corbin Bachmeier, Karen Barlow, Antonio Belli, Mark P Burns, Alan Carson, Fiona Crawford, Kristen Dams-O'Connor, Ramon Diaz-Arrastia, C Edward Dixon, Brian L Edlow, Scott Ferguson, Bruce Fischl, Rebecca D Folkerth, Steve Gentleman, Christopher C Giza, M Sean Grady, Adel Helmy, Mark Herceg, Janice L Holton, David Howell, Peter J Hutchinson, Diego Ia
Veröffentlicht in: The Lancet Neurology, Ausgabe 18/3, 2019, Seite(n) 231-233, ISSN 1474-4422
Herausgeber: The Lancet Publishing Group
DOI: 10.1016/s1474-4422(19)30020-1

A Statistically Representative Atlas for Mapping Neuronal Circuits in the Drosophila Adult Brain

Autoren: Ignacio Arganda-Carreras, Tudor Manoliu, Nicolas Mazuras, Florian Schulze, Juan E. Iglesias, Katja Bühler, Arnim Jenett, François Rouyer, Philippe Andrey
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroinformatics, Ausgabe 12, 2018, ISSN 1662-5196
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fninf.2018.00013

Hippocampal Subfield Volumetry: Differential Pattern of Atrophy in Different Forms of Genetic Frontotemporal Dementia

Autoren: Martina Bocchetta, Juan Eugenio Iglesias, Marzia A. Scelsi, David M. Cash, M. Jorge Cardoso, Marc Modat, Andre Altmann, Sebastien Ourselin, Jason D. Warren, Jonathan D. Rohrer
Veröffentlicht in: Journal of Alzheimer's Disease, Ausgabe 64/2, 2018, Seite(n) 497-504, ISSN 1387-2877
Herausgeber: IOS Press
DOI: 10.3233/JAD-180195

A probabilistic atlas of the human thalamic nuclei combining ex vivo MRI and histology

Autoren: Juan Eugenio Iglesias, Ricardo Insausti, Garikoitz Lerma-Usabiaga, Martina Bocchetta, Koen Van Leemput, Douglas N. Greve, Andre van der Kouwe, Bruce Fischl, César Caballero-Gaudes, Pedro M. Paz-Alonso
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 183, 2018, Seite(n) 314-326, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2018.08.012

Joint registration and synthesis using a probabilistic model for alignment of MRI and histological sections

Autoren: Juan Eugenio Iglesias, Marc Modat, Loïc Peter, Allison Stevens, Roberto Annunziata, Tom Vercauteren, Ed Lein, Bruce Fischl, Sebastien Ourselin
Veröffentlicht in: Medical Image Analysis, Ausgabe 50, 2018, Seite(n) 127-144, ISSN 1361-8415
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.media.2018.09.002

Effect of Fluorinert on the Histological Properties of Formalin-Fixed Human Brain Tissue

Autoren: Juan Eugenio Iglesias, Shauna Crampsie, Catherine Strand, Mohamed Tachrount, David L Thomas, Janice L Holton
Veröffentlicht in: Journal of Neuropathology & Experimental Neurology, Ausgabe 77/12, 2018, Seite(n) 1085-1090, ISSN 0022-3069
Herausgeber: American Association of Neuropathologists, Inc.
DOI: 10.1093/jnen/nly098

Segmentation of medial temporal subregions reveals early right-sided involvement in semantic variant PPA

Autoren: Martina Bocchetta, Juan Eugenio Iglesias, Lucy L. Russell, Caroline V. Greaves, Charles R. Marshall, Marzia A. Scelsi, David M. Cash, Sebastien Ourselin, Jason D. Warren, Jonathan D. Rohrer
Veröffentlicht in: Alzheimer's Research & Therapy, Ausgabe 11/1, 2019, ISSN 1758-9193
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13195-019-0489-9

Reliability and sensitivity of two whole-brain segmentation approaches included in FreeSurfer− ASEG and SAMSEG

Autoren: Sederevicius D, Vidal Piñeiro D, Sørensen O, Van Leemput K, Iglesias JE, Dalca AV, Greve DN, Fischl B, Bjørnerud A, Walhovd KB
Veröffentlicht in: NeuroImage, 2022, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2021.118113

FreeSurfer ‐based segmentation of hippocampal subfields: A review of methods and applications, with a novel quality control procedure for ENIGMA studies and other collaborative efforts

Autoren: Philipp G. Sämann, Juan Eugenio Iglesias, Boris Gutman, Dominik Grotegerd, Ramona Leenings, Claas Flint, Udo Dannlowski, Emily K. Clarke‐Rubright, Rajendra A. Morey, Theo G.M. Erp, Christopher D. Whelan, Laura K. M. Han, Laura S. Velzen, Bo Cao, Jean C. Augustinack, Paul M. Thompson, Neda Jahanshad, Lianne Schmaal
Veröffentlicht in: Human Brain Mapping, 2021, ISSN 1065-9471
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.25326

Thalamic nuclei in frontotemporal dementia: Mediodorsal nucleus involvement is universal but pulvinar atrophy is unique to C9orf72

Autoren: Martina Bocchetta, Juan E. Iglesias, Mollie Neason, David M. Cash, Jason D. Warren, Jonathan D. Rohrer
Veröffentlicht in: Human Brain Mapping, Ausgabe 41/4, 2020, Seite(n) 1006-1016, ISSN 1065-9471
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/hbm.24856

Automated segmentation of the hypothalamus and associated subunits in brain MRI

Autoren: Benjamin Billot, Martina Bocchetta, Emily Todd, Adrian V. Dalca, Jonathan D. Rohrer, Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: NeuroImage, Ausgabe 223, 2020, Seite(n) 117287, ISSN 1053-8119
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2020.117287

Differential early subcortical involvement in genetic FTD within the GENFI cohort

Autoren: Bocchetta M, Todd EG, Peakman G, Cash DM, Convery RS, Russell LL, Thomas DL, Iglesias JE, van Swieten JC, Jiskoot LC, Seelaar H, Borroni B, Galimberti D, Sanchez-Valle R, Laforce R, Moreno F, Synofzik M, Graff C, Masellis M, Tartaglia MC, Rowe JB, Vandenberghe R, Finger E, Tagliavini F, de Mendonça A, Santana I, Butler CR, Ducharme S, Gerhard A, Danek A, Levin J, Ott M, Sorbi S, Le Ber I, Pasquie
Veröffentlicht in: NeuroImage:Clinical, 2021, ISSN 2213-1582
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nicl.2021.102646

An Auto-Encoder Strategy for Adaptive Image Segmentation

Autoren: Evan M. Yu, Juan Eugenio Iglesias, Adrian V. Dalca, Mert R. Sabuncu
Veröffentlicht in: Proceedings of the Third Conference on Medical Imaging with Deep Learning, Ausgabe 121, 2020, Seite(n) 881-891
Herausgeber: PMLR

Joint segmentation of Multiple Sclerosis lesions and brain anatomy in MRI scans of any contrast and resolution with CNNs

Autoren: Billot B, Cerri S, Van Leemput K, Dalca AV, Iglesias JE:
Veröffentlicht in: IEEE ISBI, 2021
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/isbi48211.2021.9434127

Compensatory Brain Connection Discovery in Alzheimer's Disease

Autoren: Iman Aganj, Aina Frau-Pascual, Juan E. Iglesias, Anastasia Yendiki, Jean C. Augustinack, David H. Salat, Bruce Fischl
Veröffentlicht in: 2020 IEEE 17th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2020, Seite(n) 283-287, ISBN 978-1-5386-9330-8
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/isbi45749.2020.9098440

Globally Optimal Coupled Surfaces for Semi-automatic Segmentation of Medical Images

Autoren: Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: International Conference on Information Processing in Medical Imaging, 2017, Seite(n) 610-621
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-59050-9_48

Part-to-Whole Registration of Histology and MRI Using Shape Elements

Autoren: Jonas Pichat, Juan Eugenio Iglesias, Sotiris Nousias, Tarek Yousry
Veröffentlicht in: 2017 IEEE International Conference on Computer Vision Workshops (ICCVW), 2017, Seite(n) 107-115, ISBN 978-1-5386-1034-3
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/iccvw.2017.21

Retrospective head motion estimation in structural brain MRI with 3D CNNs

Autoren: Juan Eugenio Iglesias, Garikoitz Lerma-Usabiaga, Luis Garcia-Pereza-Herrera, S Martinez, Pedro Paz-Alonson MICCAI 2017314-322.
Veröffentlicht in: Proceedings of MICCAI, Ausgabe 2, 2017, Seite(n) 314-322
Herausgeber: Springer

Technical note: probabilistic visual and electromagnetic data fusion for robust drift-free sequential mosaicking. Application to fetoscopy

Autoren: Marcel Tella-Amo, Loic Peter, Dzhoshkun I. Shakir, Jan Deprest, Danail Stoyanov, Juan E. Iglesias, Tom Vercauteren, Sebastien Ourselin
Veröffentlicht in: Medical Imaging 2018: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling, 2018, Seite(n) 103, ISBN 9781-510616424
Herausgeber: SPIE
DOI: 10.1117/12.2319839

Hierarchical Joint Registration of Tissue Blocks With Soft Shape Constraints For Large-Scale Histology of The Human Brain

Autoren: M. Mancini, S. Crampsie, D.L. Thomas, Z. Jaunmuktane, J.L. Holton, J.E. Iglesias
Veröffentlicht in: 2019 IEEE 16th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2019), 2019, Seite(n) 666-669, ISBN 978-1-5386-3641-1
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/isbi.2019.8759396

Synth-by-Reg (SbR): Contrastive learning for synthesis-based registration of paired images

Autoren: Casamitjana A, Mancini M, Iglesias JE
Veröffentlicht in: International Workshop on Simulation and Synthesis in Medical Imaging, 2021
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/978-3-030-87592-3_5

A Learning Strategy for Contrast-agnostic MRI Segmentation

Autoren: Billot, Benjamin; Greve, Douglas; Van Leemput, Koen; Fischl, Bruce; Iglesias, Juan Eugenio; Dalca, Adrian V.
Veröffentlicht in: Proceedings of the Third Conference on Medical Imaging with Deep Learning, Ausgabe 121, 2020, Seite(n) 75-93
Herausgeber: Proceedings of MAchine Learning Research

Partial Volume Segmentation of Brain MRI Scans of Any Resolution and Contrast

Autoren: Benjamin Billot, Eleanor Robinson, Adrian V. Dalca, Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2020 - 23rd International Conference, Lima, Peru, October 4–8, 2020, Proceedings, Part VII, Ausgabe 12267, 2020, Seite(n) 177-187, ISBN 978-3-030-59727-6
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-59728-3_18

3D Reconstruction and Segmentation of Dissection Photographs for MRI-Free Neuropathology

Autoren: Henry F. J. Tregidgo, Adrià Casamitjana, Caitlin S. Latimer, Mitchell D. Kilgore, Eleanor Robinson, Emily Blackburn, Koen Van Leemput, Bruce Fischl, Adrian V. Dalca, Christine L. Mac Donald, C. Dirk Keene, Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2020 - 23rd International Conference, Lima, Peru, October 4–8, 2020, Proceedings, Part V, Ausgabe 12265, 2020, Seite(n) 204-214, ISBN 978-3-030-59721-4
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-59722-1_20

Unsupervised Deep Learning for Bayesian Brain MRI Segmentation

Autoren: Adrian V. Dalca, Evan Yu, Polina Golland, Bruce Fischl, Mert R. Sabuncu, Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2019 - 22nd International Conference, Shenzhen, China, October 13–17, 2019, Proceedings, Part III, Ausgabe 11766, 2019, Seite(n) 356-365, ISBN 978-3-030-32247-2
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-32248-9_40

Large-Scale Mammography CAD with Deformable Conv-Nets

Autoren: Stephen Morrell, Zbigniew Wojna, Can Son Khoo, Sebastien Ourselin, Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: Image Analysis for Moving Organ, Breast, and Thoracic Images - Third International Workshop, RAMBO 2018, Fourth International Workshop, BIA 2018, and First International Workshop, TIA 2018, Held in Conjunction with MICCAI 2018, Granada, Spain, September 16 and 20, 2018, Proceedings, Ausgabe 11040, 2018, Seite(n) 64-72, ISBN 978-3-030-00945-8
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-00946-5_7

Model-Based Refinement of Nonlinear Registrations in 3D Histology Reconstruction

Autoren: Juan Eugenio Iglesias, Marco Lorenzi, Sebastiano Ferraris, Loïc Peter, Marc Modat, Allison Stevens, Bruce Fischl, Tom Vercauteren
Veröffentlicht in: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2018 - 21st International Conference, Granada, Spain, September 16-20, 2018, Proceedings, Part II, Ausgabe 11071, 2018, Seite(n) 147-155, ISBN 978-3-030-00933-5
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-00934-2_17

A Probabilistic Model Combining Deep Learning and Multi-atlas Segmentation for Semi-automated Labelling of Histology

Autoren: Alessia Atzeni, Marnix Jansen, Sébastien Ourselin, Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2018 - 21st International Conference, Granada, Spain, September 16-20, 2018, Proceedings, Part II, Ausgabe 11071, 2018, Seite(n) 219-227, ISBN 978-3-030-00933-5
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-00934-2_25

Template-Free Estimation of Intracranial Volume: A Preterm Birth Animal Model Study

Autoren: Juan Eugenio Iglesias, Sebastiano Ferraris, Marc Modat, Willy Gsell, Jan Deprest, Johannes L. van der Merwe, Tom Vercauteren
Veröffentlicht in: Fetal, Infant and Ophthalmic Medical Image Analysis, Ausgabe 10554, 2017, Seite(n) 3-13, ISBN 978-3-319-67560-2
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-67561-9_1

Joint Inference on Structural and Diffusion MRI for Sequence-Adaptive Bayesian Segmentation of Thalamic Nuclei with Probabilistic Atlases

Autoren: Juan Eugenio Iglesias, Koen Van Leemput, Polina Golland, Anastasia Yendiki
Veröffentlicht in: Information Processing in Medical Imaging - 26th International Conference, IPMI 2019, Hong Kong, China, June 2–7, 2019, Proceedings, Ausgabe 11492, 2019, Seite(n) 767-779, ISBN 978-3-030-20350-4
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-20351-1_60

Robust joint registration of multiple stains and MRI for multimodal 3D histology reconstruction: Application to the Allen human brain atlas.

Autoren: Adrià Casamitjana; Marco Lorenzi; Sebastiano Ferraris; Loïc Peter; Marc Modat; Allison Stevens; Bruce Fischl; Tom Vercauteren; Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: EISSN: 1361-8423, Ausgabe 5, 2022, ISSN 1361-8415
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.media.2021.102265

White Matter Hyperintensity Burden Is Associated With Hippocampal Subfield Volume in Stroke

Autoren: Mark R. Etherton, Panagiotis Fotiadis, Anne-Katrin Giese, Juan E. Iglesias, Ona Wu, Natalia S. Rost
Veröffentlicht in: Frontiers in Neurology, Ausgabe 11, 2020, ISSN 1664-2295
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fneur.2020.588883

A multimodal computational pipeline for 3D histology of the human brain

Autoren: Matteo Mancini, Adrià Casamitjana, Loic Peter, Eleanor Robinson, Shauna Crampsie, David L. Thomas, Janice L. Holton, Zane Jaunmuktane, Juan Eugenio Iglesias
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-69163-z

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