Single-cell epigenomics: quantifying epigenetic changes in individual cells using DamID

Projektinformationen

EpiID

ID Finanzhilfevereinbarung: 678423

DOI

10.3030/678423

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 25 Februar 2016

Startdatum 1 April 2016

Enddatum 30 September 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

KONINKLIJKE NEDERLANDSE AKADEMIE VAN WETENSCHAPPEN - KNAW
Netherlands

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (4)

Simultaneous quantification of protein–DNA contacts and transcriptomes in single cells

Autoren: Koos Rooijers, Corina M. Markodimitraki, Franka J. Rang, Sandra S. de Vries, Alex Chialastri, Kim L. de Luca, Dylan Mooijman, Siddharth S. Dey, Jop Kind
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, Ausgabe 37/7, 2019, Seite(n) 766-772, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-019-0150-y

Genome–lamina interactions are established de novo in the early mouse embryo

Autoren: Máté Borsos, Sara M. Perricone, Tamás Schauer, Julien Pontabry, Kim L. de Luca, Sandra S. de Vries, Elias R. Ruiz-Morales, Maria-Elena Torres-Padilla, Jop Kind
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 569/7758, 2019, Seite(n) 729-733, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1233-0

DamC reveals principles of chromatin folding in vivo without crosslinking and ligation

Autoren: Josef Redolfi, Yinxiu Zhan, Christian Valdes-Quezada, Mariya Kryzhanovska, Isabel Guerreiro, Vytautas Iesmantavicius, Tim Pollex, Ralph S. Grand, Eskeatnaf Mulugeta, Jop Kind, Guido Tiana, Sebastien A. Smallwood, Wouter de Laat, Luca Giorgetti
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 26/6, 2019, Seite(n) 471-480, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0231-0

Spatial chromatin organization and gene regulation at the nuclear lamina

Autoren: Isabel Guerreiro, Jop Kind
Veröffentlicht in: Current Opinion in Genetics & Development, Ausgabe 55, 2019, Seite(n) 19-25, ISSN 0959-437X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.gde.2019.04.008