Genomic hotspots of adaptation to whole genome duplication

Projektinformationen

HOTSPOT

ID Finanzhilfevereinbarung: 679056

DOI 10.3030/679056

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 18 Dezember 2015

Startdatum 1 Januar 2016

Enddatum 31 Dezember 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 490 329,00

EU-Beitrag € 1 490 329,00

Koordiniert durch

THE UNIVERSITY OF NOTTINGHAM
United Kingdom

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (18)

Polyploidy underlies co-option and diversification of biosynthetic triterpene pathways in the apple tribe.

Autoren: Su W, Jing Y, Lin S, Yue Z, Yang X, Xu J, Wu J, Zhang Z, Xia R, Zhu J, An N, Chen H, Hong Y, Yuan Y, Long T, Zhang L, Jiang Y, Liu Z, Zhang H, Gao Y, Liu Y, Lin H, Wang H, Yant L, Lin S, and Liu Z,
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, 2021, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2101767118

Convergent evolution in Arabidopsis halleri and Arabidopsis arenosa on calamine metalliferous soils

Autoren: Veronica Preite; Christian Sailer; Lara Syllwasschy; Sian Bray; Ute Krämer; Levi Yant
Veröffentlicht in: Phil Trans Roy. Soc. B, Ausgabe 15, 2019, ISSN 0962-8436
Herausgeber: Royal Society of London
DOI: 10.1101/459362

Effects of FLOWERING LOCUS T on FD during the transition to flowering at the shoot apical meristem of Arabidopsis thaliana

Autoren: Collani, Silvio; Neumann, Manuela; Yant, Levi; Schmid, Markus
Veröffentlicht in: Plant Physiology, Ausgabe 1, 2018, ISSN 0032-0889
Herausgeber: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1101/483925

A novel allele of ASY3 is associated with greater meiotic stability in autotetraploid Arabidopsis lyrata

Autoren: Paul J. Seear; Catherine L. Gregory; Darren Heavens; Roswitha Schmickl; Roswitha Schmickl; Levi Yant; James D. Higgins
Veröffentlicht in: PLoS Genetics, Ausgabe 8, 2020, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1008900

Genomic novelty and process-level convergence in adaptation to whole genome duplication

Autoren: Bohutínská, Magdalena; Alston, Mark; Monnahan, Patrick; Bray, Sian; Paajanen, Pirita; Kolář, Filip; Yant, Levi
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe 6, 2021, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2020.01.31.929109

Interspecific introgression mediates adaptation to whole genome duplication.

Autoren: Sarah Marburger; Patrick J. Monnahan; Paul J. Seear; Simon H. Martin; Jordan Koch; Pirita Paajanen; Magdalena Bohutínská; Magdalena Bohutínská; James D. Higgins; Roswitha Schmickl; Roswitha Schmickl; Levi Yant; Levi Yant
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13159-5

Evolutionary footprints of a cold relic in a rapidly warming world

Autoren: Eva Wolf Is a corresponding author, Emmanuel Gaquerel, Mathias Scharmann, Levi Yant, Marcus A Koch
Veröffentlicht in: eLife, 2021, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.71572

Adaptation to coastal soils through pleiotropic boosting of ion and stress hormone concentrations in wild Arabidopsis thaliana.

Autoren: Silvia Busoms; Silvia Busoms; Joana Terés; Levi Yant; Charlotte Poschenrieder; David E. Salt
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 4, 2021, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17569

Maintenance of adaptive dynamics in a bottlenecked range edge population that retained outcrossing. Molecular Biology and Evolution,

Autoren: Takou M, Hämälä T, Steige K, Koch E, Dittberner H, Yant L, Genete M, Sunyaev S, Vekemans X, Savolainen O, and de Meux J
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, 2021, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msaa322

"The ""Polyploid Hop"": shifting challenges and opportunities over the evolutionary lifespan of genome duplications"

Autoren: Pierre Baduel; Sian Bray; Mario Vallejo-Marin; Filip Kolář; Filip Kolář; Levi Yant; Levi Yant
Veröffentlicht in: Frontiers in Ecology and Evolution, Ausgabe 2, 2018, ISSN 2296-701X
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fevo.2018.00117

Adaptive introgression: how polyploidy reshapes gene flow landscapes.

Autoren: Roswitha Schmickl; Roswitha Schmickl; Levi Yant
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 1, 2020, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17204

Help or hinderance? Investigating the evolutionary impact of whole genome duplication on immunogenetic diversity and parasite load in Corydoras catfishes

Autoren: Bell EA, Cable J, Oliveira C, Richardson DS, Yant L, Taylor MI
Veröffentlicht in: Ecology and Evolution, 2020, ISSN 2045-7758
Herausgeber: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.6987

Serpentine adaptation in autopolyploid Arabidopsis arenosa is dominated by repeated recruitment of shared alleles.

Autoren: Konečná V, Bray S, Vlček J, Bohutínská M, Požárová D, Choudhury R, Bollmann A, Flis P, Salt D, Parisod C, *Yant L, *Kolář F
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25256-5

Borrowed alleles and convergence in serpentine adaptation

Autoren: Brian J. Arnold, Brett Lahner, Jeffrey M. DaCosta, Caroline M. Weisman, Jesse D. Hollister, David E. Salt, Kirsten Bomblies, Levi Yant
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 113/29, 2016, Seite(n) 8320-8325, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1600405113

The genome-wide impact of cadmium on microRNA and mRNA expression in contrasting Cd responsive wheat genotypes

Autoren: Min Zhou; Shigang Zheng; Rong Liu; Lu Lu; Chihong Zhang; Lei Zhang; Levi Yant; Yu Wu
Veröffentlicht in: BMC Genomics, Ausgabe 2, 2019, ISSN 1471-2164
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12864-019-5939-z

Fluctuating selection on migrant adaptive sodium transporter alleles in coastal Arabidopsis thaliana.

Autoren: Busoms, Silvia; Paajanen, Pirita; Marburger, Sarah; Bray, Sian; Huang, Xin-Yuan; Poschenrieder, Charlotte; Yant, Levi; Salt, David E.
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 21, 2018, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1816964115

Genome-wide identification, phylogenetic and expression analysis of the heat shock transcription factor family in bread wheat ( Triticum aestivum L.)

Autoren: Zhou, Min; Zheng, Shigang; Liu, Rong; Lu, Jing; Lu, Lu; Zhang, Chihong; Liu, Zehou; Luo, Congpei; Zhang, Lei; Yant, Levi; Wu, Yu
Veröffentlicht in: BMC Genomics, Ausgabe 2, 2019, ISSN 1471-2164
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12864-019-5876-x

Polyploidy breaks speciation barriers in Australian burrowing frogs Neobatrachus.

Autoren: Polina Yu. Novikova; Ian G. Brennan; William W Booker; Michael Mahony; Paul Doughty; Alan R. Lemmon; Emily Moriarty Lemmon; J. Dale Roberts; Levi Yant; Yves Van de Peer; J. Scott Keogh; Stephen C. Donnellan; Stephen C. Donnellan
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 16, 2020, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1008769