Chemical biology approaches to unraveling the histone code

Informations projet

EPITOOLS

N° de convention de subvention: 679479

DOI 10.3030/679479

Projet clôturé

Date de signature de la CE 15 Février 2016

Date de début 1 Avril 2016

Date de fin 30 Septembre 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total € 1 758 846,00

Contribution de l’UE € 1 758 846,00

Coordonné par

UNIVERSITY OF NEWCASTLE UPON TYNE
United Kingdom

Publications

Book chapters (4)

Inhibitors of JmjC-Containing Histone Demethylases

Auteurs: Miranda Wright, Paul E. Brennan, Akane Kawamura
Publié dans: Chemical Epigenetics, Numéro 33, 2020, Page(s) 221-253, ISBN 978-3-030-42981-2
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/7355_2019_75

Chemical Compounds Targeting DNA Methylation and Hydroxymethylation

Auteurs: Roman Belle, Akane Kawamura, Paola B. Arimondo
Publié dans: Chemical Epigenetics, Numéro 33, 2020, Page(s) 255-286, ISBN 978-3-030-42981-2
Éditeur: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/7355_2019_76

CHAPTER 5. Cyclic Peptides as Chemical Probes

Auteurs: L. Serrano, G. Roper, A. Kawamura
Publié dans: The Discovery and Utility of Chemical Probes in Target Discovery, 2020, Page(s) 100-123, ISBN 978-1-78801-589-9
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/9781839160745-00100

Epigenetic Drug Discovery

Auteurs: Christoffer Højrup, Oliver D. Coleman, John-Paul Bukowski, Rasmus P. Clausen, Akane Kawamura
Publié dans: Epigenetic Drug Discovery, 2019, ISBN 9783527809257
Éditeur: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA
DOI: 10.1002/9783527809257

Peer reviewed articles (9)

Structural diversity in de novo cyclic peptide ligands from genetically encoded library technologies

Auteurs: Tom E. McAllister, Oliver D. Coleman, Grace Roper, Akane Kawamura
Publié dans: Peptide Science, Numéro 113/1, 2021, ISSN 2475-8817
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/pep2.24204

Non-competitive cyclic peptides for targeting enzyme–substrate complexes

Auteurs: T. E. McAllister, T.-L. Yeh, M. I. Abboud, I. K. H. Leung, E. S. Hookway, O. N. F. King, B. Bhushan, S. T. Williams, R. J. Hopkinson, M. Münzel, N. D. Loik, R. Chowdhury, U. Oppermann, T. D. W. Claridge, Y. Goto, H. Suga, C. J. Schofield, A. Kawamura
Publié dans: Chemical Science, Numéro 9/20, 2018, Page(s) 4569-4578, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c8sc00286j

Investigating d -lysine stereochemistry for epigenetic methylation, demethylation and recognition

Auteurs: Roman Belle, Abbas H. K. Al Temimi, Kiran Kumar, Bas J. G. E. Pieters, Anthony Tumber, James E. Dunford, Catrine Johansson, Udo Oppermann, Tom Brown, Christopher J. Schofield, Richard J. Hopkinson, Robert S. Paton, Akane Kawamura, Jasmin Mecinović
Publié dans: Chemical Communications, Numéro 53/99, 2017, Page(s) 13264-13267, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c7cc08028j

Mechanistic and structural studies of KDM-catalysed demethylation of histone 1 isotype 4 at lysine 26

Auteurs: Louise J. Walport, Richard J. Hopkinson, Rasheduzzaman Chowdhury, Yijia Zhang, Joanna Bonnici, Rachel Schiller, Akane Kawamura, Christopher J. Schofield
Publié dans: FEBS Letters, Numéro 592/19, 2018, Page(s) 3264-3273, ISSN 0014-5793
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1002/1873-3468.13231

Investigations on small molecule inhibitors targeting the histone H3K4 tri-methyllysine binding PHD-finger of JmjC histone demethylases

Auteurs: Bhaskar Bhushan, Alexandre Erdmann, Yijia Zhang, Roman Belle, Catrine Johannson, Udo Oppermann, Richard J. Hopkinson, Christopher J. Schofield, Akane Kawamura
Publié dans: Bioorganic & Medicinal Chemistry, Numéro 26/11, 2018, Page(s) 2984-2991, ISSN 0968-0896
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.bmc.2018.03.030

Thioether Macrocyclic Peptides Selected against TET1 Compact Catalytic Domain Inhibit TET1 Catalytic Activity

Auteurs: Kosuke Nishio, Roman Belle, Takayuki Katoh, Akane Kawamura, Toru Sengoku, Kazuharu Hanada, Noboru Ohsawa, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Hiroaki Suga
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 19/9, 2018, Page(s) 979-985, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.201800047

Structure-activity studies of a macrocyclic peptide inhibitor of histone lysine demethylase 4A

Auteurs: Toby Passioura, Bhaskar Bhushan, Anthony Tumber, Akane Kawamura, Hiroaki Suga
Publié dans: Bioorganic & Medicinal Chemistry, Numéro 26/6, 2018, Page(s) 1225-1231, ISSN 0968-0896
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.bmc.2018.01.013

Highly selective inhibition of histone demethylases by de novo macrocyclic peptides

Auteurs: Akane Kawamura, Martin Münzel, Tatsuya Kojima, Clarence Yapp, Bhaskar Bhushan, Yuki Goto, Anthony Tumber, Takayuki Katoh, Oliver N. F. King, Toby Passioura, Louise J. Walport, Stephanie B. Hatch, Sarah Madden, Susanne Müller, Paul E. Brennan, Rasheduzzaman Chowdhury, Richard J. Hopkinson, Hiroaki Suga, Christopher J. Schofield
Publié dans: Nature Communications, Numéro 8, 2017, Page(s) 14773, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms14773

Use of cyclic peptides to induce crystallization: case study with prolyl hydroxylase domain 2

Auteurs: Rasheduzzaman Chowdhury, Martine I. Abboud, Tom E. McAllister, Biswadip Banerji, Bhaskar Bhushan, John L. Sorensen, Akane Kawamura, Christopher J. Schofield
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-76307-8

Non-peer reviewed articles (1)

Editorial overview: Epigenetics equals chemical biology

Auteurs: Akane Kawamura, A. Ganesan
Publié dans: Current Opinion in Chemical Biology, Numéro 57, 2020, Page(s) A1-A4, ISSN 1367-5931
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2020.07.001