Chemical biology approaches to unraveling the histone code

Projektinformationen

EPITOOLS

ID Finanzhilfevereinbarung: 679479

DOI 10.3030/679479

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 15 Februar 2016

Startdatum 1 April 2016

Enddatum 30 September 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 758 846,00

EU-Beitrag € 1 758 846,00

Koordiniert durch

UNIVERSITY OF NEWCASTLE UPON TYNE
United Kingdom

Veröffentlichungen

Book chapters (4)

Inhibitors of JmjC-Containing Histone Demethylases

Autoren: Miranda Wright, Paul E. Brennan, Akane Kawamura
Veröffentlicht in: Chemical Epigenetics, Ausgabe 33, 2020, Seite(n) 221-253, ISBN 978-3-030-42981-2
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/7355_2019_75

Chemical Compounds Targeting DNA Methylation and Hydroxymethylation

Autoren: Roman Belle, Akane Kawamura, Paola B. Arimondo
Veröffentlicht in: Chemical Epigenetics, Ausgabe 33, 2020, Seite(n) 255-286, ISBN 978-3-030-42981-2
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/7355_2019_76

CHAPTER 5. Cyclic Peptides as Chemical Probes

Autoren: L. Serrano, G. Roper, A. Kawamura
Veröffentlicht in: The Discovery and Utility of Chemical Probes in Target Discovery, 2020, Seite(n) 100-123, ISBN 978-1-78801-589-9
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/9781839160745-00100

Epigenetic Drug Discovery

Autoren: Christoffer Højrup, Oliver D. Coleman, John-Paul Bukowski, Rasmus P. Clausen, Akane Kawamura
Veröffentlicht in: Epigenetic Drug Discovery, 2019, ISBN 9783527809257
Herausgeber: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA
DOI: 10.1002/9783527809257

Peer reviewed articles (9)

Structural diversity in de novo cyclic peptide ligands from genetically encoded library technologies

Autoren: Tom E. McAllister, Oliver D. Coleman, Grace Roper, Akane Kawamura
Veröffentlicht in: Peptide Science, Ausgabe 113/1, 2021, ISSN 2475-8817
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/pep2.24204

Non-competitive cyclic peptides for targeting enzyme–substrate complexes

Autoren: T. E. McAllister, T.-L. Yeh, M. I. Abboud, I. K. H. Leung, E. S. Hookway, O. N. F. King, B. Bhushan, S. T. Williams, R. J. Hopkinson, M. Münzel, N. D. Loik, R. Chowdhury, U. Oppermann, T. D. W. Claridge, Y. Goto, H. Suga, C. J. Schofield, A. Kawamura
Veröffentlicht in: Chemical Science, Ausgabe 9/20, 2018, Seite(n) 4569-4578, ISSN 2041-6520
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c8sc00286j

Investigating d -lysine stereochemistry for epigenetic methylation, demethylation and recognition

Autoren: Roman Belle, Abbas H. K. Al Temimi, Kiran Kumar, Bas J. G. E. Pieters, Anthony Tumber, James E. Dunford, Catrine Johansson, Udo Oppermann, Tom Brown, Christopher J. Schofield, Richard J. Hopkinson, Robert S. Paton, Akane Kawamura, Jasmin Mecinović
Veröffentlicht in: Chemical Communications, Ausgabe 53/99, 2017, Seite(n) 13264-13267, ISSN 1359-7345
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c7cc08028j

Mechanistic and structural studies of KDM-catalysed demethylation of histone 1 isotype 4 at lysine 26

Autoren: Louise J. Walport, Richard J. Hopkinson, Rasheduzzaman Chowdhury, Yijia Zhang, Joanna Bonnici, Rachel Schiller, Akane Kawamura, Christopher J. Schofield
Veröffentlicht in: FEBS Letters, Ausgabe 592/19, 2018, Seite(n) 3264-3273, ISSN 0014-5793
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1002/1873-3468.13231

Investigations on small molecule inhibitors targeting the histone H3K4 tri-methyllysine binding PHD-finger of JmjC histone demethylases

Autoren: Bhaskar Bhushan, Alexandre Erdmann, Yijia Zhang, Roman Belle, Catrine Johannson, Udo Oppermann, Richard J. Hopkinson, Christopher J. Schofield, Akane Kawamura
Veröffentlicht in: Bioorganic & Medicinal Chemistry, Ausgabe 26/11, 2018, Seite(n) 2984-2991, ISSN 0968-0896
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.bmc.2018.03.030

Thioether Macrocyclic Peptides Selected against TET1 Compact Catalytic Domain Inhibit TET1 Catalytic Activity

Autoren: Kosuke Nishio, Roman Belle, Takayuki Katoh, Akane Kawamura, Toru Sengoku, Kazuharu Hanada, Noboru Ohsawa, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Hiroaki Suga
Veröffentlicht in: ChemBioChem, Ausgabe 19/9, 2018, Seite(n) 979-985, ISSN 1439-4227
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.201800047

Structure-activity studies of a macrocyclic peptide inhibitor of histone lysine demethylase 4A

Autoren: Toby Passioura, Bhaskar Bhushan, Anthony Tumber, Akane Kawamura, Hiroaki Suga
Veröffentlicht in: Bioorganic & Medicinal Chemistry, Ausgabe 26/6, 2018, Seite(n) 1225-1231, ISSN 0968-0896
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.bmc.2018.01.013

Highly selective inhibition of histone demethylases by de novo macrocyclic peptides

Autoren: Akane Kawamura, Martin Münzel, Tatsuya Kojima, Clarence Yapp, Bhaskar Bhushan, Yuki Goto, Anthony Tumber, Takayuki Katoh, Oliver N. F. King, Toby Passioura, Louise J. Walport, Stephanie B. Hatch, Sarah Madden, Susanne Müller, Paul E. Brennan, Rasheduzzaman Chowdhury, Richard J. Hopkinson, Hiroaki Suga, Christopher J. Schofield
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 8, 2017, Seite(n) 14773, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms14773

Use of cyclic peptides to induce crystallization: case study with prolyl hydroxylase domain 2

Autoren: Rasheduzzaman Chowdhury, Martine I. Abboud, Tom E. McAllister, Biswadip Banerji, Bhaskar Bhushan, John L. Sorensen, Akane Kawamura, Christopher J. Schofield
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-76307-8

Non-peer reviewed articles (1)

Editorial overview: Epigenetics equals chemical biology

Autoren: Akane Kawamura, A. Ganesan
Veröffentlicht in: Current Opinion in Chemical Biology, Ausgabe 57, 2020, Seite(n) A1-A4, ISSN 1367-5931
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2020.07.001