Beyond CRISPR: Systematic characterization of novel anti-phage defense systems in the microbial pan-genome

Projektinformationen

PhageResist

ID Finanzhilfevereinbarung: 681203

DOI 10.3030/681203

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 27 März 2016

Startdatum 1 Juli 2016

Enddatum 31 Dezember 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 2 000 000,00

EU-Beitrag € 2 000 000,00

Koordiniert durch

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Israel

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (16)

Abortive Infection: Bacterial Suicide as an Antiviral Immune Strategy

Autoren: Anna Lopatina Nitzan Tal, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Annual Review of Virology, 2020, ISSN 2327-056X
Herausgeber: Annual Reviews
DOI: 10.1146/annurev-virology-011620-040628

Prokaryotic viperins produce diverse antiviral molecules

Autoren: Aude Bernheim , Adi Millman, Gal Ofir , Gilad Meitav , Carmel Avraham , Helena Shomar , Masha M Rosenberg , Nir Tal , Sarah Melamed , Gil Amitai , Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2762-2

DISARM is a widespread bacterial defence system with broad anti-phage activities

Autoren: Gal Ofir, Sarah Melamed, Hila Sberro, Zohar Mukamel, Shahar Silverman, Gilad Yaakov, Shany Doron, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 3/1, 2018, Seite(n) 90-98, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature
DOI: 10.1038/s41564-017-0051-0

Communication between viruses guides lysis–lysogeny decisions

Autoren: Zohar Erez, Ida Steinberger-Levy, Maya Shamir, Shany Doron, Avigail Stokar-Avihail, Yoav Peleg, Sarah Melamed, Azita Leavitt, Alon Savidor, Shira Albeck, Gil Amitai, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 541/7638, 2017, Seite(n) 488-493, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature21049

Repeat Size Determination by Two Molecular Rulers in the Type I-E CRISPR Array

Autoren: Moran G. Goren, Shany Doron, Rea Globus, Gil Amitai, Rotem Sorek, Udi Qimron
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 16/11, 2016, Seite(n) 2811-2818, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2016.08.043

High-resolution RNA 3′-ends mapping of bacterial Rho-dependent transcripts

Autoren: Dar, Daniel; Sorek, Rotem
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 1, 2018, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gky274

HflXr, a homolog of a ribosome-splitting factor, mediates antibiotic resistance

Autoren: Mélodie Duval, Daniel Dar, Filipe Carvalho, Eduardo P. C. Rocha, Rotem Sorek, Pascale Cossart
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 115/52, 2018, Seite(n) 13359-13364, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1810555115

Extensive reshaping of bacterial operons by programmed mRNA decay

Autoren: Daniel Dar, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 14/4, 2018, Seite(n) e1007354, ISSN 1553-7404
Herausgeber: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pgen.1007354

Systematic discovery of antiphage defense systems in the microbial pangenome

Autoren: Shany Doron, Sarah Melamed, Gal Ofir, Azita Leavitt, Anna Lopatina, Mai Keren, Gil Amitai, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 359/6379, 2018, Seite(n) eaar4120, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aar4120

Bacterial Retrons Function In Anti-Phage Defense

Autoren: Adi Millman , Aude Bernheim , Avigail Stokar-Avihail , Taya Fedorenko , Maya Voichek , Azita Leavitt, Yaara Oppenheimer-Shaanan, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Cell, 2020, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.09.065

Widespread utilization of peptide communication in phages infecting soil and pathogenic bacteria

Autoren: Avigail Stokar-Avihail, Nitzan Tal, Zohar Erez, Anna Lopatina, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Cell Host and Microbe, 2019, ISSN 1931-3128
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2019.03.017

Bacterial Noncoding RNAs Excised from within Protein-Coding Transcripts

Autoren: Daniel Dar, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: mbio, 2018, ISSN 2161-2129
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.01730-18

STING cyclic dinucleotide sensing originated in bacteria

Autoren: Benjamin R Morehouse , Apurva A Govande , Adi Millman , Alexander F A Keszei , Brianna Lowey , Gal Ofir , Sichen Shao , Rotem Sorek , Philip J Kranzusch
Veröffentlicht in: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2719-5

Diversity and classification of cyclic-oligonucleotide-based anti-phage signalling systems

Autoren: Adi Millman, Sarah Melamed, Gil Amitai, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, 2020, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-020-0777-y

Cyclic GMP–AMP signalling protects bacteria against viral infection

Autoren: Daniel Cohen, Sarah Melamed, Adi Millman, Gabriela Shulman, Yaara Oppenheimer-Shaanan, Assaf Kacen, Shany Doron, Gil Amitai, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Nature, 2019, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1605-5

The pan-immune system of bacteria: antiviral defence as a community resource

Autoren: Aude Bernheim, Rotem Sorek
Veröffentlicht in: Nature Reviews Microbiology, 2020, ISSN 1740-1526
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-019-0278-2