Descripción del proyecto
Un enfoque desde la biología de sistemas que ayude a estudiar el cáncer
Comprender la complejidad de los sistemas y fenómenos biológicos es todo un reto, pues en ellos intervienen muchos componentes que interactúan entre sí a múltiples niveles. En lugar de centrarse en el estudio de elementos aislados como los genes, las proteínas o las vías individuales, la biología de sistemas adopta un enfoque holístico basado en considerar el sistema como una red de componentes interconectados. Desde este mismo enfoque, el equipo del proyecto CanPathPro, financiado con fondos europeos, pretende desarrollar una plataforma asociada al campo de la biología de sistemas con el objetivo de verificar hipótesis relativas a la señalización del cáncer. La plataforma permitirá integrar los datos procedentes de un sistema experimental vinculado a ratones, mecanismos de secuenciación de nueva generación y estudios proteómicos en el seno de un modelo completo basado en la biología de sistemas. Con todo ello, se espera que la plataforma CanPathPro contribuya a desarrollar aplicaciones en materia de biotecnología, medicina personalizada y desarrollo de fármacos.
Objetivo
Recent developments in omics technologies demand implementation of systems biology approaches to facilitate analysis and interpretation of the generated complex datasets.This is essential for biotechnological as well as preclinical and clinical applications. In comparison to previous approaches, most cancer relevant studies are confined to pattern recognition or at best modelling of single pathways, rather than the complex pathways and cross-talk determining cancer progression and drug response. Systematic tools that evaluate and validate personalised medicine approaches on a preclinical level are missing; an important prerequisite for translation into clinical practice. The overall objective of CanPathPro is to build and validate a new biotechnological application: a combined experimental and systems biology platform, which will be utilized in testing cancer signaling hypotheses in biomedical research and life sciences. Thus, the proposed project will focus on developing and refining bioinformatic and experimental tools for the evaluation of systems biology modelling predictions. Components comprise a highly controlled mouse experimental system, NGS, a quantitative proteomics based read-out of changes in pathway signalling and an integrative systems biology model for data integration. Testable hypotheses about biological systems will be generated and experimentally validated. The developed system tools will be made available to researchers, SMEs and industry for practical applications. Following this project, a commercial platform for interpretation and analysis of complex omics data and for deriving and testing new hypotheses will be set up by the participating companies and academic partners. CanPathPro will enhance the competitive potential of the SMEs involved expanding in the field of biotechnology, personalised medicine and drug development and also provide new opportunities for other SMEs working in the field of bioinformatics and biomedical applications.
Ámbito científico
- medical and health sciencesbasic medicinepharmacology and pharmacydrug discovery
- medical and health sciencesclinical medicineoncologylung cancer
- medical and health scienceshealth sciencespersonalized medicine
- natural sciencescomputer and information sciencesartificial intelligencepattern recognition
- natural sciencesmathematicsapplied mathematicsmathematical model
Programa(s)
Convocatoria de propuestas
Consulte otros proyectos de esta convocatoriaConvocatoria de subcontratación
H2020-LEIT-BIO-2015-1
Régimen de financiación
RIA - Research and Innovation actionCoordinador
12489 Berlin
Alemania
Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención.