Opis projektu
Zastosowanie metodologii z zakresu biologii systemów w badaniach nad biologią nowotworów
Zrozumienie złożoności systemów i zjawisk biologicznych stanowi spore wyzwanie, ponieważ obejmują one wiele elementów oddziałujących ze sobą na wielu poziomach. Zaletą metodologii stosowanej w biologii systemów jest odejście od analiz pojedynczych genów, białek lub szlaków w izolacji na rzecz holistycznego podejścia, które pozwala traktować każdy układ jako sieć połączonych ze sobą wielu elementów. Finansowany przez UE projekt CanPathPro ma na celu opracowanie platformy opartej na biologii systemów, służącej do testowania hipotez dotyczących szlaków sygnałowych w przebiegu nowotworów złośliwych. W ramach platformy połączone zostaną dane uzyskane podczas badania mysiego systemu doświadczalnego, sekwencjonowania nowej generacji i badań proteomicznych, tworząc kompleksowy model biologii systemów. Uczeni zakładają, że platforma CanPathPro znajdzie zastosowanie w takich dziedzinach, jak biotechnologia, medycyna spersonalizowana i przemysł farmaceutyczny.
Cel
Recent developments in omics technologies demand implementation of systems biology approaches to facilitate analysis and interpretation of the generated complex datasets.This is essential for biotechnological as well as preclinical and clinical applications. In comparison to previous approaches, most cancer relevant studies are confined to pattern recognition or at best modelling of single pathways, rather than the complex pathways and cross-talk determining cancer progression and drug response. Systematic tools that evaluate and validate personalised medicine approaches on a preclinical level are missing; an important prerequisite for translation into clinical practice. The overall objective of CanPathPro is to build and validate a new biotechnological application: a combined experimental and systems biology platform, which will be utilized in testing cancer signaling hypotheses in biomedical research and life sciences. Thus, the proposed project will focus on developing and refining bioinformatic and experimental tools for the evaluation of systems biology modelling predictions. Components comprise a highly controlled mouse experimental system, NGS, a quantitative proteomics based read-out of changes in pathway signalling and an integrative systems biology model for data integration. Testable hypotheses about biological systems will be generated and experimentally validated. The developed system tools will be made available to researchers, SMEs and industry for practical applications. Following this project, a commercial platform for interpretation and analysis of complex omics data and for deriving and testing new hypotheses will be set up by the participating companies and academic partners. CanPathPro will enhance the competitive potential of the SMEs involved expanding in the field of biotechnology, personalised medicine and drug development and also provide new opportunities for other SMEs working in the field of bioinformatics and biomedical applications.
Dziedzina nauki
- medical and health sciencesbasic medicinepharmacology and pharmacydrug discovery
- medical and health sciencesclinical medicineoncologylung cancer
- medical and health scienceshealth sciencespersonalized medicine
- natural sciencescomputer and information sciencesartificial intelligencepattern recognition
- natural sciencesmathematicsapplied mathematicsmathematical model
Program(-y)
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSzczegółowe działanie
H2020-LEIT-BIO-2015-1
System finansowania
RIA - Research and Innovation actionKoordynator
12489 Berlin
Niemcy
Organizacja określiła się jako MŚP (firma z sektora małych i średnich przedsiębiorstw) w czasie podpisania umowy o grant.