Projektbeschreibung
Ein systembiologischer Ansatz für die Erforschung der Krebsbiologie
Das Verständnis der Komplexität biologischer Systeme und Phänomene stellt eine Herausforderung dar, da sie viele Komponenten umfassen, die auf mehreren Ebenen miteinander interagieren. Anstatt sich auf einzelne isolierte Gene, Proteine oder Stoffwechselwege zu konzentrieren, verfolgt die Systembiologie einen ganzheitlichen Ansatz und betrachtet das System als ein Netzwerk miteinander verbundener Komponenten. Das Ziel des EU-finanzierten Projekts CanPathPro ist die Entwicklung einer systembiologischen Plattform zur Prüfung von Krebssignalisierungshypothesen. Die Plattform wird Daten aus einem experimentellen Maussystem, die Sequenzierung der nächsten Generation und die Proteomik in ein umfassendes systembiologisches Modell integrieren. Es ist damit zu rechnen, dass die CanPathPro-Plattform in der Biotechnologie, der personalisierten Medizin und der Arzneimittelentwicklung Anwendung finden wird.
Ziel
Recent developments in omics technologies demand implementation of systems biology approaches to facilitate analysis and interpretation of the generated complex datasets.This is essential for biotechnological as well as preclinical and clinical applications. In comparison to previous approaches, most cancer relevant studies are confined to pattern recognition or at best modelling of single pathways, rather than the complex pathways and cross-talk determining cancer progression and drug response. Systematic tools that evaluate and validate personalised medicine approaches on a preclinical level are missing; an important prerequisite for translation into clinical practice. The overall objective of CanPathPro is to build and validate a new biotechnological application: a combined experimental and systems biology platform, which will be utilized in testing cancer signaling hypotheses in biomedical research and life sciences. Thus, the proposed project will focus on developing and refining bioinformatic and experimental tools for the evaluation of systems biology modelling predictions. Components comprise a highly controlled mouse experimental system, NGS, a quantitative proteomics based read-out of changes in pathway signalling and an integrative systems biology model for data integration. Testable hypotheses about biological systems will be generated and experimentally validated. The developed system tools will be made available to researchers, SMEs and industry for practical applications. Following this project, a commercial platform for interpretation and analysis of complex omics data and for deriving and testing new hypotheses will be set up by the participating companies and academic partners. CanPathPro will enhance the competitive potential of the SMEs involved expanding in the field of biotechnology, personalised medicine and drug development and also provide new opportunities for other SMEs working in the field of bioinformatics and biomedical applications.
Wissenschaftliches Gebiet
- medical and health sciencesbasic medicinepharmacology and pharmacydrug discovery
- medical and health sciencesclinical medicineoncologylung cancer
- medical and health scienceshealth sciencespersonalized medicine
- natural sciencescomputer and information sciencesartificial intelligencepattern recognition
- natural sciencesmathematicsapplied mathematicsmathematical model
Programm/Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigenUnterauftrag
H2020-LEIT-BIO-2015-1
Finanzierungsplan
RIA - Research and Innovation actionKoordinator
12489 Berlin
Deutschland
Die Organisation definierte sich zum Zeitpunkt der Unterzeichnung der Finanzhilfevereinbarung selbst als KMU (Kleine und mittlere Unternehmen).