Elucidating natural bilayer lipid environments

Informations projet

ENABLE

N° de convention de subvention: 695511

DOI 10.3030/695511

Projet clôturé

Date de signature de la CE 17 Mai 2016

Date de début 1 Juin 2016

Date de fin 31 Mai 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total € 2 481 744,00

Contribution de l’UE € 2 481 744,00

Coordonné par

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
United Kingdom

Publications

Peer reviewed articles (22)

N-glycan microheterogeneity regulates interactions of plasma proteins

Auteurs: Di Wu, Weston B. Struwe, David J. Harvey, Michael A. J. Ferguson, Carol V. Robinson
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 115/35, 2018, Page(s) 8763-8768, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1807439115

Allosteric Inhibition of the SARS‐CoV‐2 Main Protease: Insights from Mass Spectrometry Based Assays**

Auteurs: Tarick J. El‐Baba, Corinne A. Lutomski, Anastassia L. Kantsadi, Tika R. Malla, Tobias John, Victor Mikhailov, Jani R. Bolla, Christopher J. Schofield, Nicole Zitzmann, Ioannis Vakonakis, Carol V. Robinson
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 59/52, 2020, Page(s) 23544-23548, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202010316

Dynamics of an LPS translocon induced by substrate and an antimicrobial peptide

Auteurs: Francesco Fiorentino, Joshua B. Sauer, Xingyu Qiu, Robin A. Corey, C. Keith Cassidy, Benjamin Mynors-Wallis, Shahid Mehmood, Jani R. Bolla, Phillip J. Stansfeld, Carol V. Robinson
Publié dans: Nature Chemical Biology, Numéro 17/2, 2021, Page(s) 187-195, ISSN 1552-4450
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-020-00694-2

Structure of native lens connexin 46/50 intercellular channels by cryo-EM

Auteurs: Janette B. Myers, Bassam G. Haddad, Susan E. O’Neill, Dror S. Chorev, Craig C. Yoshioka, Carol V. Robinson, Daniel M. Zuckerman, Steve L. Reichow
Publié dans: Nature, Numéro 564/7736, 2018, Page(s) 372-377, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0786-7

The use of sonicated lipid vesicles for mass spectrometry of membrane protein complexes

Auteurs: Dror S. Chorev, Haiping Tang, Sarah L. Rouse, Jani Reddy Bolla, Andriko von Kügelgen, Lindsay A. Baker, Di Wu, Joseph Gault, Kay Grünewald, Tanmay A. M. Bharat, Stephen J. Matthews, Carol V. Robinson
Publié dans: Nature Protocols, Numéro 15/5, 2020, Page(s) 1690-1706, ISSN 1754-2189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41596-020-0303-y

Combining native and ‘omics’ mass spectrometry to identify endogenous ligands bound to membrane proteins

Auteurs: Joseph Gault, Idlir Liko, Michael Landreh, Denis Shutin, Jani Reddy Bolla, Damien Jefferies, Mark Agasid, Hsin-Yung Yen, Marcus J. G. W. Ladds, David P. Lane, Syma Khalid, Christopher Mullen, Philip M. Remes, Romain Huguet, Graeme McAlister, Michael Goodwin, Rosa Viner, John E.P. Syka, Carol V. Robinson
Publié dans: Nature Methods, Numéro 17/5, 2020, Page(s) 505-508, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-020-0821-0

Modular detergents tailor the purification and structural analysis of membrane proteins including G-protein coupled receptors

Auteurs: Leonhard H. Urner, Idlir Liko, Hsin-Yung Yen, Kin-Kuan Hoi, Jani Reddy Bolla, Joseph Gault, Fernando Gonçalves Almeida, Marc-Philip Schweder, Denis Shutin, Svenja Ehrmann, Rainer Haag, Carol V. Robinson, Kevin Pagel
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-14424-8

In Situ Structure of an Intact Lipopolysaccharide-Bound Bacterial Surface Layer

Auteurs: Andriko von Kügelgen, Haiping Tang, Gail G. Hardy, Danguole Kureisaite-Ciziene, Yves V. Brun, Phillip J. Stansfeld, Carol V. Robinson, Tanmay A.M. Bharat
Publié dans: Cell, Numéro 180/2, 2020, Page(s) 348-358.e15, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.12.006

Phospho‐regulation, nucleotide binding and ion access control in potassium‐chloride cotransporters

Auteurs: Gamma Chi, Rebecca Ebenhoch, Henry Man, Haiping Tang, Laurence E Tremblay, Gabriella Reggiano, Xingyu Qiu, Tina Bohstedt, Idlir Liko, Fernando G Almeida, Alexandre P Garneau, Dong Wang, Gavin McKinley, Christophe P Moreau, Kiran D Bountra, Patrizia Abrusci, Shubhashish M M Mukhopadhyay, Alejandra Fernandez‐Cid, Samira Slimani, Julie L Lavoie, Nicola A Burgess‐Brown, Ben Tehan, Frank DiMaio, Al
Publié dans: The EMBO Journal, 2021, ISSN 0261-4189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2020107294

Dendritic Oligoglycerol Regioisomer Mixtures and Their Utility for Membrane Protein Research

Auteurs: Leonhard H. Urner, Katharina Goltsche, Marleen Selent, Idlir Liko, Marc‐Philip Schweder, Carol V. Robinson, Kevin Pagel, Rainer Haag
Publié dans: Chemistry – A European Journal, Numéro 27/7, 2021, Page(s) 2537-2542, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202003991

A new azobenzene-based design strategy for detergents in membrane protein research

Auteurs: Leonhard H. Urner, Maiko Schulze, Yasmine B. Maier, Waldemar Hoffmann, Stephan Warnke, Idlir Liko, Kristin Folmert, Christian Manz, Carol V. Robinson, Rainer Haag, Kevin Pagel
Publié dans: Chemical Science, Numéro 11/13, 2020, Page(s) 3538-3546, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0sc01022g

The importance of the membrane for biophysical measurements

Auteurs: Dror S. Chorev, Carol V. Robinson
Publié dans: Nature Chemical Biology, Numéro 16/12, 2020, Page(s) 1285-1292, ISSN 1552-4450
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-020-0574-1

Ligand binding to a G protein–coupled receptor captured in a mass spectrometer

Auteurs: Hsin-Yung Yen, Jonathan T. S. Hopper, Idlir Liko, Timothy M. Allison, Ya Zhu, Dejian Wang, Monika Stegmann, Shabaz Mohammed, Beili Wu, Carol V. Robinson
Publié dans: Science Advances, Numéro 3/6, 2017, Page(s) e1701016, ISSN 2375-2548
Éditeur: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.1701016

Identifying key membrane protein lipid interactions using mass spectrometry

Auteurs: Kallol Gupta, Jingwen Li, Idlir Liko, Joseph Gault, Cherine Bechara, Di Wu, Jonathan T S Hopper, Kevin Giles, Justin L P Benesch, Carol V Robinson
Publié dans: Nature Protocols, Numéro 13/5, 2018, Page(s) 1106-1120, ISSN 1754-2189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nprot.2018.014

Native Desorption Electrospray Ionization Liberates Soluble and Membrane Protein Complexes from Surfaces

Auteurs: Stephen Ambrose, Nicholas G. Housden, Kallol Gupta, Jieyuan Fan, Paul White, Hsin-Yung Yen, Julien Marcoux, Colin Kleanthous, Jonathan T. S. Hopper, Carol V. Robinson
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 56/46, 2017, Page(s) 14463-14468, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201704849

PtdIns(4,5)P2 stabilizes active states of GPCRs and enhances selectivity of G-protein coupling

Auteurs: Hsin-Yung Yen, Kin Kuan Hoi, Idlir Liko, George Hedger, Michael R. Horrell, Wanling Song, Di Wu, Philipp Heine, Tony Warne, Yang Lee, Byron Carpenter, Andreas Plückthun, Christopher G. Tate, Mark S. P. Sansom, Carol V. Robinson
Publié dans: Nature, Numéro 559/7714, 2018, Page(s) 423-427, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0325-6

Protein assemblies ejected directly from native membranes yield complexes for mass spectrometry

Auteurs: Dror S. Chorev, Lindsay A. Baker, Di Wu, Victoria Beilsten-Edmands, Sarah L. Rouse, Tzviya Zeev-Ben-Mordehai, Chimari Jiko, Firdaus Samsudin, Christoph Gerle, Syma Khalid, Alastair G. Stewart, Stephen J. Matthews, Kay Grünewald, Carol V. Robinson
Publié dans: Science, Numéro 362/6416, 2018, Page(s) 829-834, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aau0976

The role of interfacial lipids in stabilizing membrane protein oligomers

Auteurs: Kallol Gupta, Joseph A. C. Donlan, Jonathan T. S. Hopper, Povilas Uzdavinys, Michael Landreh, Weston B. Struwe, David Drew, Andrew J. Baldwin, Phillip J. Stansfeld, Carol V. Robinson
Publié dans: Nature, Numéro 541/7637, 2017, Page(s) 421-424, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature20820

Integrating mass spectrometry with MD simulations reveals the role of lipids in Na+/H+ antiporters

Auteurs: Michael Landreh, Erik G. Marklund, Povilas Uzdavinys, Matteo T. Degiacomi, Mathieu Coincon, Joseph Gault, Kallol Gupta, Idlir Liko, Justin L. P. Benesch, David Drew, Carol V. Robinson
Publié dans: Nature Communications, Numéro 8, 2017, Page(s) 13993, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms13993

From molecular chaperones to membrane motors: through the lens of a mass spectrometrist

Auteurs: Carol V. Robinson
Publié dans: Biochemical Society Transactions, Numéro 45/1, 2017, Page(s) 251-260, ISSN 0300-5127
Éditeur: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20160395

Structure of the Fanconi anaemia monoubiquitin ligase complex

Auteurs: Shabih Shakeel, Eeson Rajendra, Pablo Alcón, Francis O’Reilly, Dror S. Chorev, Sarah Maslen, Gianluca Degliesposti, Christopher J. Russo, Shaoda He, Chris H. Hill, J. Mark Skehel, Sjors H. W. Scheres, Ketan J. Patel, Juri Rappsilber, Carol V. Robinson, Lori A. Passmore
Publié dans: Nature, Numéro 575/7781, 2019, Page(s) 234-237, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1703-4

Direct observation of the influence of cardiolipin and antibiotics on lipid II binding to MurJ

Auteurs: Jani Reddy Bolla, Joshua B. Sauer, Di Wu, Shahid Mehmood, Timothy M. Allison, Carol V. Robinson
Publié dans: Nature Chemistry, Numéro 10/3, 2018, Page(s) 363-371, ISSN 1755-4330
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nchem.2919