Elucidating natural bilayer lipid environments

Projektinformationen

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ID Finanzhilfevereinbarung: 695511

DOI 10.3030/695511

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 17 Mai 2016

Startdatum 1 Juni 2016

Enddatum 31 Mai 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 2 481 744,00

EU-Beitrag € 2 481 744,00

Koordiniert durch

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
United Kingdom

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (22)

N-glycan microheterogeneity regulates interactions of plasma proteins

Autoren: Di Wu, Weston B. Struwe, David J. Harvey, Michael A. J. Ferguson, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 115/35, 2018, Seite(n) 8763-8768, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1807439115

Allosteric Inhibition of the SARS‐CoV‐2 Main Protease: Insights from Mass Spectrometry Based Assays**

Autoren: Tarick J. El‐Baba, Corinne A. Lutomski, Anastassia L. Kantsadi, Tika R. Malla, Tobias John, Victor Mikhailov, Jani R. Bolla, Christopher J. Schofield, Nicole Zitzmann, Ioannis Vakonakis, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe 59/52, 2020, Seite(n) 23544-23548, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202010316

Dynamics of an LPS translocon induced by substrate and an antimicrobial peptide

Autoren: Francesco Fiorentino, Joshua B. Sauer, Xingyu Qiu, Robin A. Corey, C. Keith Cassidy, Benjamin Mynors-Wallis, Shahid Mehmood, Jani R. Bolla, Phillip J. Stansfeld, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Nature Chemical Biology, Ausgabe 17/2, 2021, Seite(n) 187-195, ISSN 1552-4450
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-020-00694-2

Structure of native lens connexin 46/50 intercellular channels by cryo-EM

Autoren: Janette B. Myers, Bassam G. Haddad, Susan E. O’Neill, Dror S. Chorev, Craig C. Yoshioka, Carol V. Robinson, Daniel M. Zuckerman, Steve L. Reichow
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 564/7736, 2018, Seite(n) 372-377, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0786-7

The use of sonicated lipid vesicles for mass spectrometry of membrane protein complexes

Autoren: Dror S. Chorev, Haiping Tang, Sarah L. Rouse, Jani Reddy Bolla, Andriko von Kügelgen, Lindsay A. Baker, Di Wu, Joseph Gault, Kay Grünewald, Tanmay A. M. Bharat, Stephen J. Matthews, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Nature Protocols, Ausgabe 15/5, 2020, Seite(n) 1690-1706, ISSN 1754-2189
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41596-020-0303-y

Combining native and ‘omics’ mass spectrometry to identify endogenous ligands bound to membrane proteins

Autoren: Joseph Gault, Idlir Liko, Michael Landreh, Denis Shutin, Jani Reddy Bolla, Damien Jefferies, Mark Agasid, Hsin-Yung Yen, Marcus J. G. W. Ladds, David P. Lane, Syma Khalid, Christopher Mullen, Philip M. Remes, Romain Huguet, Graeme McAlister, Michael Goodwin, Rosa Viner, John E.P. Syka, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 17/5, 2020, Seite(n) 505-508, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-020-0821-0

Modular detergents tailor the purification and structural analysis of membrane proteins including G-protein coupled receptors

Autoren: Leonhard H. Urner, Idlir Liko, Hsin-Yung Yen, Kin-Kuan Hoi, Jani Reddy Bolla, Joseph Gault, Fernando Gonçalves Almeida, Marc-Philip Schweder, Denis Shutin, Svenja Ehrmann, Rainer Haag, Carol V. Robinson, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-14424-8

In Situ Structure of an Intact Lipopolysaccharide-Bound Bacterial Surface Layer

Autoren: Andriko von Kügelgen, Haiping Tang, Gail G. Hardy, Danguole Kureisaite-Ciziene, Yves V. Brun, Phillip J. Stansfeld, Carol V. Robinson, Tanmay A.M. Bharat
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 180/2, 2020, Seite(n) 348-358.e15, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.12.006

Phospho‐regulation, nucleotide binding and ion access control in potassium‐chloride cotransporters

Autoren: Gamma Chi, Rebecca Ebenhoch, Henry Man, Haiping Tang, Laurence E Tremblay, Gabriella Reggiano, Xingyu Qiu, Tina Bohstedt, Idlir Liko, Fernando G Almeida, Alexandre P Garneau, Dong Wang, Gavin McKinley, Christophe P Moreau, Kiran D Bountra, Patrizia Abrusci, Shubhashish M M Mukhopadhyay, Alejandra Fernandez‐Cid, Samira Slimani, Julie L Lavoie, Nicola A Burgess‐Brown, Ben Tehan, Frank DiMaio, Al
Veröffentlicht in: The EMBO Journal, 2021, ISSN 0261-4189
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2020107294

Dendritic Oligoglycerol Regioisomer Mixtures and Their Utility for Membrane Protein Research

Autoren: Leonhard H. Urner, Katharina Goltsche, Marleen Selent, Idlir Liko, Marc‐Philip Schweder, Carol V. Robinson, Kevin Pagel, Rainer Haag
Veröffentlicht in: Chemistry – A European Journal, Ausgabe 27/7, 2021, Seite(n) 2537-2542, ISSN 0947-6539
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202003991

A new azobenzene-based design strategy for detergents in membrane protein research

Autoren: Leonhard H. Urner, Maiko Schulze, Yasmine B. Maier, Waldemar Hoffmann, Stephan Warnke, Idlir Liko, Kristin Folmert, Christian Manz, Carol V. Robinson, Rainer Haag, Kevin Pagel
Veröffentlicht in: Chemical Science, Ausgabe 11/13, 2020, Seite(n) 3538-3546, ISSN 2041-6520
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0sc01022g

The importance of the membrane for biophysical measurements

Autoren: Dror S. Chorev, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Nature Chemical Biology, Ausgabe 16/12, 2020, Seite(n) 1285-1292, ISSN 1552-4450
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-020-0574-1

Ligand binding to a G protein–coupled receptor captured in a mass spectrometer

Autoren: Hsin-Yung Yen, Jonathan T. S. Hopper, Idlir Liko, Timothy M. Allison, Ya Zhu, Dejian Wang, Monika Stegmann, Shabaz Mohammed, Beili Wu, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 3/6, 2017, Seite(n) e1701016, ISSN 2375-2548
Herausgeber: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.1701016

Identifying key membrane protein lipid interactions using mass spectrometry

Autoren: Kallol Gupta, Jingwen Li, Idlir Liko, Joseph Gault, Cherine Bechara, Di Wu, Jonathan T S Hopper, Kevin Giles, Justin L P Benesch, Carol V Robinson
Veröffentlicht in: Nature Protocols, Ausgabe 13/5, 2018, Seite(n) 1106-1120, ISSN 1754-2189
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nprot.2018.014

Native Desorption Electrospray Ionization Liberates Soluble and Membrane Protein Complexes from Surfaces

Autoren: Stephen Ambrose, Nicholas G. Housden, Kallol Gupta, Jieyuan Fan, Paul White, Hsin-Yung Yen, Julien Marcoux, Colin Kleanthous, Jonathan T. S. Hopper, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe 56/46, 2017, Seite(n) 14463-14468, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201704849

PtdIns(4,5)P2 stabilizes active states of GPCRs and enhances selectivity of G-protein coupling

Autoren: Hsin-Yung Yen, Kin Kuan Hoi, Idlir Liko, George Hedger, Michael R. Horrell, Wanling Song, Di Wu, Philipp Heine, Tony Warne, Yang Lee, Byron Carpenter, Andreas Plückthun, Christopher G. Tate, Mark S. P. Sansom, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 559/7714, 2018, Seite(n) 423-427, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0325-6

Protein assemblies ejected directly from native membranes yield complexes for mass spectrometry

Autoren: Dror S. Chorev, Lindsay A. Baker, Di Wu, Victoria Beilsten-Edmands, Sarah L. Rouse, Tzviya Zeev-Ben-Mordehai, Chimari Jiko, Firdaus Samsudin, Christoph Gerle, Syma Khalid, Alastair G. Stewart, Stephen J. Matthews, Kay Grünewald, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 362/6416, 2018, Seite(n) 829-834, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aau0976

The role of interfacial lipids in stabilizing membrane protein oligomers

Autoren: Kallol Gupta, Joseph A. C. Donlan, Jonathan T. S. Hopper, Povilas Uzdavinys, Michael Landreh, Weston B. Struwe, David Drew, Andrew J. Baldwin, Phillip J. Stansfeld, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 541/7637, 2017, Seite(n) 421-424, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature20820

Integrating mass spectrometry with MD simulations reveals the role of lipids in Na+/H+ antiporters

Autoren: Michael Landreh, Erik G. Marklund, Povilas Uzdavinys, Matteo T. Degiacomi, Mathieu Coincon, Joseph Gault, Kallol Gupta, Idlir Liko, Justin L. P. Benesch, David Drew, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 8, 2017, Seite(n) 13993, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms13993

From molecular chaperones to membrane motors: through the lens of a mass spectrometrist

Autoren: Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Biochemical Society Transactions, Ausgabe 45/1, 2017, Seite(n) 251-260, ISSN 0300-5127
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20160395

Structure of the Fanconi anaemia monoubiquitin ligase complex

Autoren: Shabih Shakeel, Eeson Rajendra, Pablo Alcón, Francis O’Reilly, Dror S. Chorev, Sarah Maslen, Gianluca Degliesposti, Christopher J. Russo, Shaoda He, Chris H. Hill, J. Mark Skehel, Sjors H. W. Scheres, Ketan J. Patel, Juri Rappsilber, Carol V. Robinson, Lori A. Passmore
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 575/7781, 2019, Seite(n) 234-237, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1703-4

Direct observation of the influence of cardiolipin and antibiotics on lipid II binding to MurJ

Autoren: Jani Reddy Bolla, Joshua B. Sauer, Di Wu, Shahid Mehmood, Timothy M. Allison, Carol V. Robinson
Veröffentlicht in: Nature Chemistry, Ausgabe 10/3, 2018, Seite(n) 363-371, ISSN 1755-4330
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nchem.2919