Obiettivo
DNA polymerases (DNA Pols) make various decisions during DNA replication. Decisions regarding nucleotide selection, lesion bypass and how to respond to replication errors are a few important examples. During replication, DNA Pols can synthesize DNA at remarkable rates, e.g. 1,000 bp/s for E. Coli DNA Pol III. However, errors can be introduced during replication, resulting in a terminal DNA mismatch. Mismatches can then be sensed and removed by action of the 3’ to 5’ exonuclease activity of the DNA Pol. How DNA Pols can sense mismatches to initiate proofreading and how the primer strand migrates into the exonuclease domain, often a distance of 30 Å, is the focus of this proposal. Moreover, this research aims to understand mechanisms of proofreading in higher complexity DNA Pol assemblies at single-molecule resolution. Proofreading will be studied with the model enzyme E. Coli DNA Pol III, consisting of separate protein subunits that assemble to form a higher order complex, namely the polymerase, exonuclease and the β2-clamp, which is a processivity factor that encircles the DNA and increases the affinity of the polymerase to the DNA. The proposed work will employ single-molecule FRET in order to evaluate proofreading dynamics at high spatial and temporal resolution. Three main objectives will be performed in order to understand (1) how DNA mismatches initiate proofreading (2) how mutations within the exonuclease domain affect proofreading and (3) how DNA lesions can influence proofreading as a function of position within the DNA template. These objectives will be achieved with a single-molecule FRET assay containing fluorescently labelled DNA to monitor proofreading dynamics in real time. This work will shift the knowledge frontier by advancing our understanding of proofreading during DNA replication in order to better realise the relationship between DNA mutations and the development of human diseases like cancer.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze naturali scienze chimiche chimica organica ammine
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine enzimi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2015
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
SW7 2AZ London
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.