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Smart capture phases for proteomics, glycomics and biomarker assays

Description du projet

Des technologies basées sur l’empreinte moléculaire détectent les biomarqueurs protéiques du cancer

Après la traduction, les protéines subissent des modifications post-traductionnelles (MPT) afin d’élargir leur diversité fonctionnelle et de réguler leur structure, leur localisation, leur activité et leurs interactions au sein des cellules. Les MPT se présentent sous la forme de petits groupes chimiques ajoutés à des résidus d’acides aminés, et certains d’entre eux semblent être en corrélation avec la croissance et la progression des tumeurs. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet BioCapture entend développer des matériaux intelligents sous forme de polymères à empreintes moléculaires (PEM) et mener des tests basés sur les PEM afin de détecter les biomarqueurs protéiques associés au cancer et analyser les MPT au sein des protéines. Les résultats du projet auront un impact de taille sur les soins de santé car ils permettront un diagnostic plus précoce et plus fiable des maladies et une identification plus rapide des cibles et des biomarqueurs dans le cadre de la recherche de nouveaux médicaments.

Objectif

The overall objective of BioCapture is to develop novel robust assays for proteinaceous biomarkers associated with cancer
and to develop innovative tools for assaying elusive cancer related posttranslational modifications in proteins. This will be
achieved by exploiting robust glycan, peptide and protein binders in the form of Molecularly Imprinted Polymers (MIPs) or plastic antibodies alongside generic enrichment combined with selected reaction monitoring-based mass spectrometry assays. In addition, sequence specific MIPs for multiple proteotypic peptides will be developed for use as capture phases in array format followed by MS or fluorescence based readout as well as a coupling of both detection techniques. The artificial receptors will be developed by various Molecular Imprinting techniques. The research results will lead to technological advances having a major impact on 1) health care since it will profit from methods for earlier, more reliable diagnosis of diseases, 2) drug discovery allowing a faster target or biomarker identification; and 3) biochemistry research laboratories in resulting in improved protein fractionation tools for revealing low abundant post translational modifications. The training of researchers will be performed by a consortium consisting of in total 15 partners whereof 6 polymer/materials research groups, 5 protein/glycan chemistry/analysis groups, 1 separation technology companies, 2 expert groups on platforms for multiplex analysis and one diagnostic company. This forms the basis for a very exciting interdisciplinary training program. Thus 11 early stage researchers (ESRs) working on specific tasks within five work packages will follow a rich training program providing a well-balanced spectrum of scientific, business and entrepreneurial skills.

Coordinateur

MALMO UNIVERSITET
Contribution nette de l'UE
€ 565 695,72
Adresse
NORDENSKIOLDSGATAN 1
205 06 Malmoe
Suède

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Région
Södra Sverige Sydsverige Skåne län
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 565 695,72

Participants (7)

Partenaires (6)